Added doxygen script for smartThings Things SDK

Added doxygen script for wifi manager

Merge pull request #661 from sunghan-chang/remove_lcd

drivers: remove lcd stubs

drivers: remove lcd stubs

The lcd is imcomplete and unnecessary. Let's remove it.

Merge pull request #648 from Taejun-Kwon/fs_journaling

Apply verification code for transaction logging.

Merge pull request #660 from sunghan-chang/samsungartik

Sync up kernel side with SamsungARTIK

artik053: modify memorymap figure

I changed the address value to the wrong one. I added a little
explanation.

Change-Id: Ia54ed094944156b7945654d3f8e5dcc91f4f6a89
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
build/configs/artik053/scripts/README.md

s5j/serial: refactor up_rxavailable()

When determining the availability of Rx FIFO, combining UFSTAT[8] and
UFSTAT[7:0] looks more tidy and clean.

Change-Id: I1b35dd2afae710375c0bf616f7eeae615fdb8cd6
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/serial: fix RX availability check

UFSTAT[7:0] holds the number of data in Rx FIFO, but zero when Rx FIFO
is full. Thus, we need additional check on UFSTAT[8] bit to ensure that
the FIFO is empty, if the count is zero. Otherwise, up_rxavailable() may
return 'false' even when Rx FIFO is full, though it is less likely to
happen.

Change-Id: Iffd65bf356dd840e864553daf8aa9a7f04a0368e
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/serial: rename UFSTAT bitfield

For better consistency,

    s/UART_UFSTAT_RX_FIFO_MASK/UART_UFSTAT_RX_FIFO_FULL_MASK/

Change-Id: Idb50bd4eb490f85d8e291f073ba9fad00fa850ce
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/serial: fix initialization order

GPIO pinmux configuration should be done before starting to supply PCLK
and EXTCLK to UART when opening it. Otherwise, a noise signal may be
introduced into the receiving FIFO, causing an odd RX interrupt. For the
same reason, this also applies when closing it.

This commit fixes the issue that select() and poll() fails on serial
devices.

Change-Id: I05309a1637574936f53a529d018dd28600b14295
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/pwm: add pwm register value initialization

The register value used in bl2 still remain. So it must be initialized.

Change-Id: I6bbc5484116b941810ba0399f7a90852fc2eee86
Signed-off-by: Bongryul Lee <bongryul.lee@samsung.com>

s5j/pwm: fix 32bit integer overflow when arithmetic operation

Change-Id: I216557d33653bfbda9b46333847e9872b979992e
Signed-off-by: Bongryul Lee <bongryul.lee@samsung.com>

Merge pull request #658 from Taejun-Kwon/fs_common

Add missing fclose state

Add missing fclose state

Pass toplevel make to the script to allow -j greater than 1

Change-Id: I39c5b6aae94eb662119064f1fa59841be74055d5
Signed-off-by: David Sidrane <david_s5@nscdg.com>
[Shin: cherry-picked from the upstream]
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

Merge pull request #649 from JeonginKim/master

Added doxygen script for audio framework

Merge pull request #651 from shivgarg/tinyalsa

Removing limits.h and interval.h files from tinyalsa

Merge pull request #656 from lokeshbv/build_fixes

Fix: Remove duplicate entry in 'os/arch/arm/src/s5j/Make.defs'

Merge pull request #646 from tadziopazur/setjmp_fix

setjmp/longjmp thumb build fix

Merge pull request #655 from Taejun-Kwon/audio_defconfig

Minimize Audio's defconfig

examples/sensorbd_demo: fix uart examples about buffer init

In the uart example, the initialization of the rx buffer was missing.

Change-Id: Iafdacd16e3f9f4644bb92bc969e6f1d96cdf0d6f
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

s5j/serial: fix invalid clock configuration on UART4

UARTDBG has incorrect PCLK and EXTCLK configurations. This may cause
system hang when we access UARTDBG if it is not set as a default
console.

Change-Id: Ibbc427e170a7174504e755cdc9732ca83ce9ed1c
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

Fix: Remove duplicate entry in 'os/arch/arm/src/s5j/Make.defs'

Fix "Makefile:174: target `s5j_clock.o' given more than once in the same rule"
Removed the duplicate entry 'CHIP_CSRCS += s5j_clock.c' in 'os/arch/arm/src/s5j/Make.defs'

Signed-off-by: Lokesh B V <lokesh.bv@partner.samsung.com>

s5j/i2c: fix svace warning

I changed some warnings found in the svace test.
- remove unnecessary casting

Change-Id: I9173e7f75338748064c80835ccc08967ecfa9cb5
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

s5j/serial: add constraints on UART flowcontrol

RTS/CTS pins of UART2/3 are shared with other peripherals. To ensure
that those pins are mutually exclusive, add dependencies on Kconfig
entries.

Change-Id: I0ce100a082b0ce2a58d9a2b7259d2f73bbace155
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

artik053: add new line parameter in lldbg

Missing new line parameters were in some lldbg. This can degrade the
readability of the error log when abnormal.

Change-Id: I1794caf247102cf9bcd720260d680e34e6270950
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
os/arch/arm/src/artik053/src/artik053_tash.c

s5j/serial: fix UART problem caused by executing ioctl()'s TCSETS

This patch fixes UART commucation problem that occurs after executing
ioctl()'s TCSETS case. Because the TCSETS executes up_setup() which
disables all interrupts, UART commucation will be blocked after doing
ioctl()'s TCSETS case. In ioctl()'s TCSETS case, this patch replaces
up_setup() with up_configure(). The up_configure() function configures
baud, bits, parity and etc. without disabling all interrupts.

Change-Id: I43c624c13e37d883553ca0b0f498fb9a1663150d
Signed-off-by: Wonsang Ryou <wonsang.yoo@samsung.com>

s5j/serial: refactor up_setup()

This patch separates up_configure() function, which configures baud
rate, bits and parity, from up_setup(). The up_configure() function
can be called when baud, bits or parity is initialized or changed.

Change-Id: I6f12d57f969fe0fbbde0e13583bde4f0032bccd6
Signed-off-by: Wonsang Ryou <wonsang.yoo@samsung.com>

examples/tls_server: fix svace warning

This commit fixes svace warning about UNREACHABLE_CODE.

Change-Id: I5937a681e34fa29195026f64a4260a1c4fb2de01
Signed-off-by: Joohwan Kim <joohwani.kim@samsung.com>

s5j/watchdog: fix svace warning

I changed some warnings found in the svace test.
- I added a NULL check on the structure to prevent errors.

Change-Id: I50438ea5df62c7f5d77ecfcb8a00fcddd6200990
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
os/arch/arm/src/s5j/s5j_watchdog_lowerhalf.c

apps/examples: fix svace warning

I changed some warnings found in the svace test.
- I added a return check to some functions.
- Changed unnecessary variable settings.

Change-Id: Iaf4c2785dafe085e9a887ed0e8dc969bd398e244
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
apps/examples/security_api/security_api_tc_main.c

Minimize Audio's defconfig

examples/tls: fix README.txt files for tls client/server

This commit fixes app command in README test.

Change-Id: Ib9326fab2613811b987af341b3af822b53c84ddb
Signed-off-by: Joohwan Kim <joohwani.kim@samsung.com>

examples/smart_test: fix memory leak

Some fd values were not properly close after open. This can cause memory
leaks.

Change-Id: Ia4a62910370751ad3da3954baa7ad5383c193e2b
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/mtdpart: fix depend on RAMMTD

'CONFIG_RAMMTD' is required to run the mtdpart example.

Change-Id: If3218b3ee9a27f5d80e1ec21c22faf419e2c2005
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

artik053: fix trivial typo

'EXTENTION' may be misspelled. perhaps 'EXTENSION'

Change-Id: I74e660e2f802005d60dc536343f86b66d168c833
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
build/configs/artik053/securitytest/defconfig

Removing limits.h and interval.h files from tinyalsa

Apply verification code for transaction logging.
Sometimes eletronic power grow up after power off, in this case
FS treats writing logging finished properly.

cJSON: remove warning about prototype
Some functions of cJSON did not have a prototype. This can sometimes
cause a warning when building.

Change-Id: If47338e11f13a77f2a5d2283160245fa4868cfec
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

tools/mkkconfig: sort apps in menuconfig

When searching for Kconfig in apps with the find command, it was not
output in numerical order. It is a patch that sort only the output
results.

Change-Id: I3b0822735a633de329dcb7ff16c95c33115dedd9
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

s5j/pm: add dynamic clock scaling support per PM state

To reduce power consumption, use OSCCLK of 26MHz as source clock of
DIV_WPLL_DIV3, instead of WPLL_CLK960M of 960MHz. It may reduce the
amount of power consumption up to about 25mA while the system falls into
PMSTOP or PMSTANDBY state.

Change-Id: If9a70c35ed1576cd61e60de6f9942332f022d337
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/serial: add runtime PM support

This commit adds runtime support calls to notify PM state machine when
UART activity is detected.

Change-Id: Ie549fbca6020b0b664dfb7a60a83e0fbbc6e5083
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>
Conflicts:
os/arch/arm/src/s5j/s5j_serial.c

s5j/serial: enable clockgating on UARTs

To reduce dynamic power consumption, UART clocks are set to be disabled
while we are not using it. Except the UARTDBG, all other UARTs will be
unavailable until it is opened through /dev node.

Change-Id: Ibc4c8b750697d1f8ad1ee42764cd7485666d6d04
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/serial: retrieve UCLK freq from clock driver

In S5J, source clock of UART can be one of following: OSCCLK and
WPLL_DIV12. Now that the clock driver is available, we may retrieve
clock frequency of the source clock, instead of using hard-coded clock
value.

Change-Id: Idc372a8c30cd214da545d40baf1eed9f723102d2
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/mct: retrieve TCLK freq from clock driver

Instead of using hard-coded clock frequency, retrieve it from the clock
driver.

Change-Id: Iac7ccbfb364016889ec62323698a12e26cb90d3b
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/pwm: retrieve SCLK freq from clock driver

Instead of using hard-coded clock value, retrieve it from the clock
driver.

Change-Id: I87de159783280ee0ea9fb03ba01d902bf352fd91
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/clk: rework CMU driver

Change-Id: I7725455a27572e72331b686933ad61a3af0de94f
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>
Conflicts:
os/arch/arm/src/s5j/Kconfig
os/arch/arm/src/s5j/chip/s5jt200_cmu.h
os/arch/arm/src/s5j/s5j_clock.c
os/arch/arm/src/s5j/s5j_clock.h
os/arch/arm/src/s5j/s5j_spi.c

s5j/pm: add missing callbacks for PM framework

BSP should provide an implementation of up_idle() in order to use the PM
framework that NuttX supports, but it is missing in S5J. This commit
adds up_idle() and other additional callback implementation. However,
this commit does not any functional differences at all, because PM
callbacks are blank and doing nothing for now.

Change-Id: Iced2074dd71afd545b6cf1ed74164e3cc525a019
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/pwm: verify the result of pinmux control

Change-Id: I8ce31f4f16322077ab71360115a4f183ac7e1c7a
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

s5j/pm: drop broken PM stuff

PM stuff has been left abandoned since it was introduced just for
proof-of-concept. It is time to clean up. This commit gets rid of those
broken code lines and also invalid comments that were copy-and-pasted
from other NuttX BSP.

This commit does not cause any functional differences because codes that
are being touched were not actually called from anywhere.

Change-Id: Id5b23b2149c7e048b08485ccdd148130ca6579b4
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>
Conflicts:
os/arch/arm/src/s5j/Kconfig
os/arch/arm/src/s5j/Make.defs

s5j/pm: fix invalid build rule on PM

s5j_pm*.c should be included when CONFIG_PM=y, not
CONFIG_ARCH_CUSTOM_PMINIT.

Change-Id: I14ff07bf542c8e8e3a1c73b26328558a51f50ac2
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

tools/mkkconfig: mkkconfig not to complaining

mkkconfig.sh is a script for generating Kconfig recursively. Sometimes
it spits a trivial warning that is very annoying to see as following:

    mkkconfig in /home/heesub/Documents/artik053/tinyara/apps/netutils
    mkkconfig in /home/heesub/Documents/artik053/tinyara/apps/netutils
    ls: cannot access '/home/heesub/Documents/artik053/tinyara/apps/netutils/*/Kconfig_ENTRY': No such file or directory

This commit should stop mkkconfig.sh from complaining and will hopefully
save someone from having to debug it.

Change-Id: Iaef3cb00cc011d09d1d4abeda430dc16a56ddf83
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

build: fix incorrect definition on build order

The target 'memstat' becomes available to be built after $(BIN) is
ready. In other words, 'memstat' depends on $(BIN). However, build rule
does not reflect this fact, and thus fails when it runs with -j option
greater than 1 as following:

    LN: include/apps to ../apps/include
    make[1]: Entering directory '/home/heesub/Documents/artik053/tinyara/apps'
    Traceback (most recent call last):
      File "./tools/memstats_gnueabil.py", line 42, in <module>
        infile = open(options.infilename,'r')
    IOError: [Errno 2] No such file or directory: '../build/output/bin/tinyara.map'
    Makefile.unix:618: recipe for target 'memstat' failed
    make: *** [memstat] Error 1
    make: *** Waiting for unfinished jobs....

This commit fixes this.

Change-Id: Ic1c7251caaa378411548bf66d3bdc73ad822fce6
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>
Conflicts:
os/Makefile.unix

Added doxygen script for audio framework

artik053/openocd: reset the target on prepare_target()

prepare_target() fails sometimes when the target is in abnormal state
like data abort, and we need to push the reset button. In such cases,
it is not enough to give 'halt' command. 'reset halt' seems to be
appropriate.

Change-Id: I15e197a8e7232924cfeac8d064fb4f46a84d09cf
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

examples/smart_test: fix append test

I append some data to the end of the file. There was an error in the
starting position setting for searching data.

Change-Id: I9346b8ca4f2c0f34bd8253caea667cb3dae622fe
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/sensorbd_demo: fix thread safety on SPI examples

In the case of spi, the user directly calls the os level define at the
app level. So when using spi, the user must first check the device data
value.

Change-Id: Ic73bc6f9a76ace75d55952c6b94aa36306b25c5f
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

i2c: fix thread safety

In the i2c_read / i2c_write function at the os level, a problem may
occur when the device data value is not declared. This patch is modified
to check the device data value first to ensure thread safety.

Change-Id: I7a47791939412ef8b2828526de7130276bd3a03c
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

Merge pull request #643 from sunghan-chang/artik053_userfs

artik053: cleanup download script

Merge pull request #647 from sangwon03/gpio_sync

fix the issue that didn't receive event from gpio pin.

Merge pull request #645 from JeongJunSik/prinf_remove

Remove unnecessary log output

fix the issue that didn't receive event from gpio pin.
gpio.c is synchronized with ARTIK053 repo.

Fix setjmp/longjmp implementation for thumb mode (i.e.: tiva, which is Cortex M3, based on armv7-m architecture).
Compiles for armv7-a/r in both arm and thumb modes and for armv7-m.

unneed debuging message

s5j: fix invalid calculations on sector offsets

The size of sector is stored in '.blocksize' field of data structure for
mtd device instance and we should use it when calculating sector
offsets. On the other hand, '.erasesize' holds the size of erase unit
that underlying flash device supports and might be quite different with
sector size. This commit fixes code lines that are confusing them.
Fortunately, those buggy lines have not yet caused any harm, because
both numbers are the same, but this will break the system soon when
start to use different units on them. So let's fix them all.

Change-Id: I2a115fb7dd648257941577f85b9461be81abebde
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

artik053/Kconfig: remove unnecessary if statement

'artik053/Kconfig' is included only when ARCH_BOARD_ARTIK053 is set.
Thus, checking it seems redundant.

Change-Id: I90b5b8a57d041abf2b25d4e2deadbe245548febb
Signed-off-by: Heesub Shin <heesub.shin@samsung.com>

examples/wave_gen: fix config name

I modified it to use the config that I set in Kconfig correctly.

Change-Id: Ia975ad7d133ae3fc8b957e2d121fc1090c92af99
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
apps/examples/wave_gen/Makefile

apps: fix trivial typo

Fix trivial typo

Change-Id: Id89bc4b81f8a22e1406dfce3700dcbeeea70b22e
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>
Conflicts:
apps/include/nxplayer.h

s5j: fix trivial typo

Fix trivial typo

Change-Id: I0d1488053975d71591713a730575e107c8187d09
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/sensorbd_demo: fix define naming

I want to delete "S5J" prefix.

Change-Id: I6c9a6fb13833272a20fcb1be7595b40c5a1b466c
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/smart_test: fix append mode when disk has been fulled

This patch includes fix about append mode. In append mode, calculate the
number of lines and perform the append test.

Change-Id: I5b2bdefd3750c4628309ca09fd67a2fc3ae8e4a4
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/sysio_test: add dependencies on driver subsystems

Depending on the dependencies of the sysio driver, this example might
cause a build error. This patch adds the dependencies of the driver.

Change-Id: I7dfb0d284af1adbe4a82dd2ae47d4196cfe5185a
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

examples/sensorbd_demo: add SAMSUNG License

This patch includes adding missing Samsung License.

Change-Id: Ic3ee7ae33eddd43fb4a74b9fd64ceb37b61af08c
Signed-off-by: Junhwan Park <junhwan.park@samsung.com>

artik053: fix trivial typo in Make.def

s/LDFLAAGS/LDFLAGS/

This enables the linker option '--gc-sections' that was not actually
applied so far, reducing binary footprints a little.

Change-Id: I227df3213598cb986068a317d6c5e741ae365850
Signed-off-by: Bongryul Lee <bongryul.lee@samsung.com>

artik053: cleanup download script

1. Split romfs stubs from main
2. Support low-case character for ALL option
3. Remove temporarily file, romfs_flashing.cfg when execution is failed

Merge pull request #642 from jarvisjang/resolve_crash

Resolve crash issue on audio_utc

Resolve crash issue on audio_utc

Merge pull request #641 from sunghan-chang/artik053_userfs

artik053: add flashing script to erase user fs

artik053: add flashing script to erase user fs

Sometimes, we should erase user fs at first flashing on new board.
So, ERASE_USERFS option is added.

Merge pull request #590 from HONGCHAEHEE/download-file

Update download file and README for ROMFS (related commit :  fa2cd4c )

Update artik053 download file and README for ROMFS (related commit: fa2cd4c)

Merge pull request #637 from sunghan-chang/appupdate

apps/tools: fix update_config.sh for issue on update entry point

apps/tools: fix update_config.sh for issue on update entry point

When user entry point is changed through make applist/appupdate,
CONFIG_ENTRY_XX is not updated, only CONFIG_USER_ENTRYPOINT is.
So, it looks not changed on menuconfig.
Let's change it to manaul when entry is changed.

Merge pull request #636 from hs0225/modify_iotjs

Fix iot.js build config

Fix iot.js build config

to remove build warnning, fix build config

Merge pull request #595 from pillip8282/websocket_fix

examples:websocket fix strncpy bug

Merge pull request #634 from junmin-kim/framework_iotbus

Add missed logic of iotbus

Merge pull request #635 from junmin-kim/audio_debug

Remove duplicated debug macro

Remove duplicated debug macro

Add missed logic of iotbus

pwm_get_duty_cyle : return pecentage value
gpio_set_direction : ioctl when IOTBUS_GPIO_DIRECTION_NONE

Merge pull request #622 from dr-venkman/fix_dm_utc

Fix unit testcases for DM

Merge pull request #633 from davidfather/wifi_manager

Fix missing null termination in wifi_manager & wifi_test

Merge pull request #632 from daeyeon/fix.net-connect

fix iotjs net connection test

Fix missing null termination in wifi_manager

1. Use strlen(str) + 1 instead of strlen(str) when calculating the length of ssid or passphrase
2. Add checkpoint logic to judge that ssid length is greater than 31 and passphrase length is greather than 63.

Fix missing null termination at strncat() in wifi_test.c

1. Use snprintf instead of sprintf with maximum length - 1
2. Tackle the overflow when string concatenating

fix iotjs net connection test

This gets the net_connection test fixed through moving the time when closing server.  The test purpose is to test 'net.connect'.

Merge pull request #631 from jeongarmy/stream_doxygen

Add doxygen for stream API in include/tinyara/streams.h

Merge pull request #603 from shivgarg/internal_syncup

Audio framework

Add doxygen for stream API in include/tinyara/streams.h

Additionally, there are testcases for these functions in fs tc except internal functions