Android toolchain: restored explicit include_directories of system /usr/include

It is needed because of explicit STL include paths.
Otherwise some standard headers (like fenv.h) can not not be correctly found by the compiler.

Merge https://github.com/urikz/opencv

Fix gcc build errors and warnings

Small fixed #3

Small fixed #2

Small fixes

Merge remote-tracking branch 'itseez/opencv'

Conflicts:
modules/video/src/simpleflow.cpp
modules/video/test/test_simpleflow.cpp

Update to improve performance of SimpleFlow algorithm

+ Improve performance of calcOpticalFlowSingleScale method
+ Small refactoring

Current results:

IMAGE NAMES          RMSE
Beanbags
Dimetrodon           0.329428
DogDance
Grove2               0.550852
Grove3               1.464699
Hydrangea            0.523277
MiniCooper
RubberWhale          0.367246
Urban2               2.717003
Urban3               4.185070
Venus                0.775422
Walking

Time (for Urban3):
17.490248 sec

changed eps in validate_result function

More strict tests for image waring algorithms

Fix android build warnings

Merge branch 'android-toolchain'

Fix precompiled headers support detection for gcc-4.6 toolchain from Android NDK r8b

The version reported by toolchain is 4.6.x-google so regex needs an adjustment.

Android toolchain: protect from changes of NDK_CCACHE on subsequent cmake

Fix Android build with CMake 2.6.3-2.8.3

Improved CMake warnings about known problems of Android NDKs

Partially cleaned 'operations_on_arrays' section of undocumented parameters.

restored SSE2 and added AVX optimization of the old haar face detector

fixed 4-channel resizeAreaFast x2 decimation case

fixed multiple build warnings

updated documentation with the new PCA functionality

Overloaded PCA constructor and ( ) operator to implement Feature#2287 - PCA that retains a specified amount of variance from the data. A sample was added to samples/cpp to demonstrate the new functionality. Docs and Tests were also updated

fixed bug #2331

Merge branch 'master' of git://code.opencv.org/opencv

Issue #2270 OpenCV Manager fails with JNI error fixed.
Local reference table overflow in JNI code fixed.

fix bug of ocl::canny

Added C++ runtime search for standalone toolchain

Fixing STL support in case of standalone toolchain

Fix executable and C objects linking

added SSE2-optimized boxfilter by Grigoriy Frolov

added openfabmap code, contributed by Arren Glover. fixed several warnings in the new versions of retina filters

Merge pull request #28: add openexr to 3rdparty libs

Fix openexr build on Linux

add channel 3 for test/main.cpp
add remap

A little fix to ocl accuracy tests, make them more uniformed

update some of the functions in ocl module to the latest version

Add support for all NDK runtimes

Update readme for 3rdparty libs

Fix openexr build on MinGW

Fix openexr build with MSVC

Added OpenEXR library v1.7.1

Add NDK release detection into CMake toolchain

Several small fixes in Android CMake toolchain

* fix formatting
* honor Windows-style paths
* suppress warnings inside try_compile
* correct caching of toolchain variables

Remove debug print

Cleaned 'old_basic_structures' of undocumented parameters.

removed duplicated sample (for facedetect)

Fix Android samples for devices having front camera only (Nexus 7)

Fix package name of Android color blob detection sample

Unify manifest files in Android examples

updated Retina module code for more flexible parallelisation : TBB parallel for loops are replaced by opencv parallel_for_ wrapper... compile error corrected

updated code for more flexible parallelisation : TBB parallel for loops are replaced by opencv parallel_for_ wrapper

fixed build warnings on Windows

Merge remote-tracking branch 'origin/master'

Small fixes for SimpleFlow algorithm

+ Fixed warnings
+ Add new function calcOpticalFlow with smaller number of arguments
+ Add asserts to algorithm and remove 'exit(1)'

Updates for SimpleFlow algorithm

+ New format for flow data - CV_32C2
+ Memory optimization
+ Cross Bilateral Filter optimization
+ Minor optimizations
+ Sample for calcOpticalFlowSF improved

"SimpleFlow" optical flow estimation algorithm (GSoC project) declaration in includes, implementation, usage example, test

update FFMPEG wrapper binaries

probably fixed compile error on MacOSX 10.6

Small fixes for SimpleFlow algorithm

+ Fixed warnings
+ Add new function calcOpticalFlow with smaller number of arguments
+ Add asserts to algorithm and remove 'exit(1)'

Merge branch 'master' of git://code.opencv.org/opencv

updated retina documentation

use mutex provided by opencv itself
add getoclcontext and getoclcommandqueue so that other opencl program can interactive with opencv ocl module
correct haar test cases
add face detection sample

Merge pull request #27 from sergiud/master

Fix libjasper build on 32-bit MinGW

Fix MinGW warning on implicit 'exit' declaration

Merge branch 'master' of git://code.opencv.org/opencv

added retina module documentation

fixed building BRISK on Windows

win32: always link to vfw32

add a scale invariance test for the detector

revert orientation computation in jeypoint detection for efficiency (like done originally)

add const correctness, replace __inline__ and remote a useless release()

add rotation tests for the descriptors

add more test to BRISK

initial addition of BRISK with some tests

split FAST in order to reuse it in BRISK

added a few missing images for tutorials; integrated pull request #26

added ios tutorials by Charu Hans and Eduard Feicho

Fix build warning introduced in commit:424bc609b6f352a2b10f2a01ffcd037483e3591f

performance fix of convertC3C4
add OCL 1.2 feature for setTo
bug fix of integral
replace the error code -217 with suitable MACRO
simplify tests, no need apply a new context for each test case
add more control for tests in utility.hpp

fixed build without CUDA

fixed bug in buildPointList

3rdparty libs are updated to latest available versions

Update readme for 3rdparty libs

Fix libjasper build with MSVC

Add changelog and copyright files from debian libjasper-dev (1.900.1-13) package

Apply 03-CVE-2011-4516-and-CVE-2011-4517 patch from debian libjasper-dev (1.900.1-13) package

Apply 02-fix-filename-buffer-overflow patch from debian libjasper-dev (1.900.1-13) package

Apply 01-misc-fixes patch from debian libjasper-dev (1.900.1-13) package

Update libjpeg to release 8d

Update libtiff to release v4.0.2

Fix Android build with cmake 2.6.3

Enable libpng NEON optimization in Android build for armeabi-v7a with NEON target

Update libpng to release v1.5.12

Update zlib to release v1.2.7

minor

Merge branch 'master' of git://code.opencv.org/opencv

Retina module is now parallelized thanks to the TBB library. Speed increase expected on multicore plateforms

added GPU bilateral filter + tests

added GPU non local means brute force filter + tests

renamed device::bilaterl_filter kernel to device::disp_bilaterl_filter for correct naming

fixed some warnings