make: bump version to rc4

Document switch to explicit flags for docker: cpu / gpu.

Merge pull request #5242 from CDLuminate/doc-update-debian-guide

docs: update install_apt_debian guide

docs: update install_apt_debian guide

Merge pull request #5227 from williford/caffe-git-pr2

Fix broken links in layer documentation, minor fixes.

Fix broken links in layer documentation, minor fixes.

Merge pull request #5220 from kts/bugfix

parse_log.py was not using --verbose argument

parse_log.py was not using --verbose argument

Merge pull request #5215 from cypof/fix_restore

Restore can be invoked on rank > 0

Restore can be invoked on rank > 0

Merge pull request #5207 from CDLuminate/cmake-bump-soversion-to-rc4

cmake: bump soversion to rc4

cmake: bump soversion to rc4

Merge pull request #5153 from cypof/docker

Docker refresh: simplified & update to 16.04, cuda8, cudnn5, nccl

Docker refresh: simplified & update to 16.04, cuda8, cudnn5, nccl

Merge pull request #5198 from longjon/config-backslash

Remove trailing backslash on comment in Makefile.config.example

Merge pull request #5184 from shaibagon/fix_batch_norm_param_upgrade

fix harsh upgrade_proto for `"BatchNorm"` layer to zero instead of clear params

Merge pull request #3365 from BonsaiAI/wrap-declarations-in-switch

Fix syntax inside switch for Windows compilation

copyright spans 2014-2017

ignore generated includes for docs

[build] remove trailing backslash on comment

Merge pull request #4842 from willyd/pytest-fix

fix pytest temporary files on Windows

remove redundant operations in Crop layer (#5138)

Merge pull request #5025 from hmybmny/master

[docs] fix glog download link

Merge pull request #5098 from yaronli/master

check leveldb iterator status for snappy format

Merge pull request #5121 from yrevar/patch-2

Join path using "os.path.join" instead of "+"

Merge pull request #5142 from lvchaxj/master

Fix parse_log tool for negative time duration if datetime across year boundary

Merge pull request #5176 from stoneyang/minor

fix minor typo in bvlc_googlenet

Fix various documentation typos (#4172)

* fix typo (standaraized->standardized)
* fix typo (convet->convert, etc..)
* fix typo (incompartible->incompatible)
* fix typo (does't->doesn't)
* fix typo (decoded->decode)

Merge pull request #5148 from caffe-help/caffe-docs-PR1

Overhaul layer catalogue documentation

Merge pull request #5181 from willyd/download-model-py3

Python 2/3 compatible download_model_binary.py

Merge pull request #4563 from cypof/nccl

adopt NVIDIA's NCCL for multi-GPU and switch interface to python

fixing upgrade_proto for BatchNorm layer: be more conservative leave "name" in param, only set lr_mult and decay_mult to zero

Merge pull request #5075 from tsocha/master

Fix mkl issue #4836

Merge pull request #5111 from CDLuminate/add-debian-install-guide

docs: add debian installation guide

Python 2/3 compatible download_model_binary.py

minor typo

Merge pull request #4338 from raffienficiaud/master

[cmake] fix glog upstream autoconf for Ubuntu 16.04

Using default from proto for prefetch

Python layers should build on multiprocess & solver_cnt; enable with bindings

Python Multi-GPU

Switched multi-GPU to NCCL

Logging from python, e.g. for lower log level on multi-GPU workers

docs: add some tables to debian install guide and misc update

docs: change UTF-8 characters

docs: update debian installation guide. Thanks to @lukeyeager for comments.

Add Debian codenames and make link.

Add the Debian codenames / versions, so it is easier to tell which Debian version is which in the future when the releases are promoted.

Revise commit according to CDLuminate's comments.

Removed rolling release numbers. Mention that Debian/testing can install Caffe using the packages.

Overhaul layer catalogue documentation.

Create scripts/split_caffe_proto.py file for splitting up the
caffe.proto file, so that parts of the file can be included from the
layer help pages.

Create separate pages for each layer and link each page from layers.md.

Fix parse_log.py and parse_log.sh for negative time duration if datetime in log across year boundary

Merge pull request #5139 from ftokarev/patches

Fixed typos in test_inner_product_layer.cpp

Typos in test_inner_product_layer.cpp

Join path using "os.path.join" instead of "+"

(Needless to say it's much clearer, less error prone, and portable)

Merge pull request #5112 from yrevar/patch-1

Fixed a typo

Fixed a typo

Use mkl_malloc when use mkl

docs: add debian installation guide

check leveldb iterator status for snappy format.

Merge pull request #5057 from Queuecumber/cuda-pascal-cmake

[build] Add Pascal to all cuda architectures

Add Pascal to all cuda architectures

The known gpu architectures were missing the Pascal sm_60 and sm_61 compute capabilities. When building for this GPU, but on a separate machine, like a CI server or inside a docker image, caffe would be built for at most capability sm_50 and crash when run on the Pascal GPU.

Merge pull request #5038 from CDLuminate/fix-spelling

Make lint happy (> 80 characters)

Add the missing period

Make lint happy (> 80 characters)

Merge pull request #5035 from CDLuminate/fix-spelling

fix many typos by using codespell

fix many typos by using codespell

Revert "solver: check and set type to reconcile class and proto"

as pointed out by #5028 this does not achieve what it intended, and
furthermore causes trouble with direct solver instantiation.

revert commit e52451de914312b80a83459cb160c2f72a5b4fea

fix error link

Merge pull request #5009 from shelhamer/solver-type-check

Solver: check and set type to reconcile class and proto type

Merge pull request #4998 from chenzeyuczy/master

Add missing spaces besides equal signs in batch_norm_layer.cpp

Checks inside Xcode for latest OSX SDK (#4840)

OS X: build with latest SDK by default

solver: check and set type to reconcile class and proto

the solver checks its proto type (SolverParameter.type) on
instantiation:

- if the proto type is unspecified it's set according to the class type
  `Solver::type()`
- if the proto type and class type conflict, the solver dies loudly

this helps avoid accidental instantiation of a different solver type
than intended when the solver def and class differ. guaranteed type
information in the SolverParameter will simplify multi-solver
coordination too.

Merge pull request #4703 from cypof/avoid_missing_returns

Avoids missing return values during build

Merge pull request #4979 from davidbrai/allow-parse_log-to-skip-lines

Support solver resumes in parse_log.py

Add missing spaces besides equal signs in batch_norm_layer.cpp

Merge pull request #4986 from shelhamer/sigce-ignore

Sigmoid Cross-Entropy Loss: ignore selected targets by `ignore_label`

sigmoid cross-entropy loss: normalize loss by different schemes

sig-ce loss handles all the same normalizations as the softmax loss;
refer to #3296 for more detail.

this preserves the default normalization for sig-ce loss: batch size.

Merge pull request #4993 from shelhamer/bitfusion-ami

docs: include installation pointer to AWS AMI

docs: include AWS AMI pointer

docs: Guillaume Dumont is the Windows maintainer

sigmoid cross-entropy loss: ignore selected targets by `ignore_label`

sig-ce learns to ignore by zeroing out the loss/diff at targets equal to
the configured `ignore_label`.

n.b. as of now the loss/diff are not properly normalized when there are
ignored targets. sig-ce loss should adopt the same normalization options
as softmax loss.

support solver resumes in parse_log.py

Currently parse_log.py skips all non timestamped lines
only once. When resuming a solver and appending to the
same log file, it creates more non timestamped log lines.
This change allows the script to silently skip those lines.

Merge pull request #4971 from williford/docs-installation-add-quotes

Put quotes around titles in YAML front matter of installation docs to remove errors

Put quotes around titles in YAML front matter.

The colon produces errors unless the title is in quotes. This causes the minor
issue of the HTML title not being set.

See:
https://github.com/jekyll/jekyll/issues/549

Merge pull request #4914 from williford/issue_template

Add GitHub issue template to curb misuse

Add Github issue template to curb misuse.

For information on Github issue templates, see:
https://github.com/blog/2111-issue-and-pull-request-templates

The template has been revised according to discussion with @shelhamer
and @willyd on pull request BVLC/caffe#4914.

Merge pull request #4941 from karas84/caffe-pr

corrected typo in accuracy_layer.hpp: MaxTopBlos -> MaxTopBlobs

Merge pull request #4937 from nihui/patch-1

add the missing star in comment

corrected typo in accuracy_layer.hpp: MaxTopBlos -> MaxTopBlobs

add the missing star in comment

a trival commit which adds the missing star ;)

Merge pull request #4908 from shelhamer/sigce-gpu

Sigmoid Cross-Entropy Loss: add GPU forward for full GPU mode speed-up

sigmoid cross-entropy loss: add GPU forward for full GPU mode

close #3004

pytest fix: Files created with NamedTemporary files cannot be opened on Windows

Merge pull request #4813 from Shamanoid/patch-1

Fix: docs/yum_install.md glog broken link

Merge pull request #4812 from wk910930/fix-typo

fix typo in pascal_multilabel_datalayers.py

Fix: docs/yum_install.md glog broken link

fixes the broken glog link in yum_install.md which is currently returning a 404.

fix typo in pascal_multilabel_datalayers.py

Merge pull request #4793 from cypof/cudnn_path

NV changed path to cuDNN

NV changed path to cudnn

Merge pull request #4785 from bwilbertz/slightly_relax_batch_norm_check

slightly relax batch norm check

slightly relax batch norm check

Merge pull request #4779 from shelhamer/ignore-visualstudio

Ignore Visual Studio Metadata

Ignore Visual Studio Code files.

Merge pull request #4769 from lukeyeager/bvlc/travis-protobuf3-url

[TravisCI] google/protobuf renamed the 3.0 branch