Merge pull request #5598 from ZoroDerVonCodier/patch-1

Update euclidean_loss_layer.hpp with corrected reference in comment

Merge pull request #6210 from mzsanford/classfier_deprecation_warning

Update Classifier and Detector to avoid deprecation warning

Update Classifier and Detector to avoid deprecation warning

Merge pull request #5545 from brunobowden/shape_mismatch_checks

Shape mismatch CHECK logging improvements

corrected description of set_transpose in io.py

Merge pull request #5865 from cheshirekow/fix/caffe_rpath

Fix cmake RPATH

Merge pull request #6202 from shelhamer/fix-scratch-bottom-diff

Clear Scratch Diffs to Prevent Contaminating Backward through Splits

explain use of scratch diffs in comments

a few layers make use of otherwise unused diffs to accumulate results,
but unless the diffs are cleared in forward this contaminates the
gradients when these layers share a bottom and their backward is
skipped.

clear scratch use of accuracy bottom diff

clear scratch use of loss bottom diffs

Merge pull request #5924 from bowang/cudnn_deconv

speed-up: add cuDNN deconvolution layer and test

Merge pull request #6201 from shelhamer/official-aws-ami

installation: switch pointer to official AWS AMI

docs: switch to official AWS AMI

Merge pull request #6048 from sclarkson/master

Fix Makefile parallel builds missing protobuf header

Merge pull request #6121 from xerus/typo

Cuda.cmake: Fix a typo in a comment

Cuda.cmake: Fix a typo in a comment

Merge pull request #6084 from Noiredd/accuracy-count-fix

Added count==0 safeguard to CPU accuracy calculation

Added count==0 safeguard to CPU accuracy calculation

Merge pull request #6079 from Noiredd/cuda9-makefile

Makefile example comments for CUDA 9.0 compatibility

Makefile example comments for CUDA 9.0 compatibility

Fix Makefile parallel builds missing protobuf header

Merge pull request #5972 from icyblade/icyblade-patch-1

add support for cuDNN v7

Merge pull request #5719 from leemgs/upstream-issue5718

Fix: mean shape incompatible with input shape

Fix: mean shape in compatible with input shape

This commit is to fix issue #5718.

* reference:
1. https://groups.google.com/forum/#!topic/caffe-users/nBpWJCcJoCU
2. https://stackoverflow.com/questions/28692209/using-gpu-despite-setting-cpu-only-yielding-unexpected-keyword-argument

Signed-off-by: Geunsik Lim <geunsik.lim@samsung.com>

Merge pull request #5813 from jqueguiner/patch-1

fix web demo install instruction link

Merge pull request #5704 from ArneSuppe/dupDistDirFix

Fixed bug where make distribute duplicates python files

Merge pull request #5969 from developius/fix-default-mode-warning

Fix default mode warning in io.resize_image

Merge pull request #5866 from cijianzy/update_link_to_google_style_guide

Update link to google style guide.

Merge pull request #5973 from Noiredd/pytest

Add absolute tolerance to test_net.py to prevent random Travis fails

infogain loss: fix bottom blobs description

Merge pull request #5925 from BVLC/williford-install-ubuntu-16.04-patch-1

[docs] packages needed by Ubuntu 16.04, not just Ubuntu 14.04

Add absolute tolerance to test_net.py to prevent random Travis fails

add supports for cuDNN v7

upgrading Accuracy layer: (1) efficient CPU implementation O(L) for top_k, no need for fancy priority_queue etc. (2) GPU implementation

Fix default mode warning in io.resize_image

Signed-off-by: Finnian Anderson <get@finnian.io>

[docs] fix link to `AbsVal` layer

Merge pull request #5713 from Noiredd/filler

fix bilinear filler (and make constant filler more strict, as it should be)

Fixed bilinear filler, added tests

Merge pull request #5904 from longjon/gpu-ptr

Expose GPU pointers to Python

Packages needed by Ubuntu 16.04 also

This line is needed for Ubuntu 16.04:

    sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev

For reference:

* https://github.com/BVLC/caffe/wiki/Ubuntu-16.04-or-15.10-Installation-Guide
* https://youtu.be/DnIs4DRjNL4

Fix format

Implement CuDNN-based deconvolution layer and test

Expose GPU pointers to Python

The pointers could be used by CUDA wrapper libraries in Python such as
PyCUDA, gnumpy, Theano etc.

Merge pull request #5900 from wasnot/fix/py3-division-compat

Fix division operator for Compatibility of python 3 in classifier.py

modified division operator for compatibility of python 3

Update link to google style guide.

Fix caffe rpath

The logic for setting the library RPATH checks whether or not
${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/lib is a system directory, and if not
adds it to the library RPATH. However, caffe does not install
to ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/lib, it installs to
${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/${CMAKE_INSTALL_LIBDIR} (from
GNUInstallDirs). CMAKE_INSTALL_LIBDIR may be something like
"lib/x86_64-linux-gnu"

Update README.md

Mention SKX support

Merge pull request #5824 from ek9852/master

[cmake] fix hardcode xcode path

Fix hardcode xcode path

User may not install xcoder into default directory
especially if there are two different versions of xcoder installed.

Merge pull request #5753 from CDLuminate/docs-update-deb-ub

[docs] update apt installation guide for Debian and Ubuntu

Merge pull request #5760 from Lydorn/patch-1

[docs] fix spelling for LRN

Merge pull request #5770 from skylarjhdownes/master

API updates in Logistic Regression example

[DOC][FIX] fix web demo install instruction link

update deprecated pandas call

pd.scatter_matrix -> pd.plotting.scatter_matrix

update sklearn calls to use latest API

Version 0.18 moved cross-validation to sklearn.model_selection - see http://scikit-learn.org/stable/whats_new.html#version-0-18
Version 0.17 deprecated class_weight="auto" in favor of class_weight="balanced"

Update lrn.md

Fixed typo "locaitons " -> "location" in line 17

docs: add Ubuntu package tracker link in Ubuntu guide

docs: update apt installation guide for Debian and Ubuntu

Caffe package is available for APT since Debian 9.0 and Ubuntu 17.04 .

Fixed bug where make distribute duplicates python files in distribute/python

Update README.md

Merge pull request #5687 from BVLC/readme_list_branches

List branches in readme

List branches in readme

Merge pull request #5624 from CDLuminate/cmake-rename-static-proto-library

cmake: rename libproto.a -> libcaffeproto.a

Merge pull request #5625 from CDLuminate/docs-update

docs/debian guide: update compiler combination table

docs/debian guide: update compiler combination table

cmake: rename libproto.a -> libcaffeproto.a

Merge pull request #5617 from lukeyeager/boost-1.54

Downgrade boost requirement from 1.55 to 1.54

Downgrade boost requirement from 1.55 to 1.54

Update euclidean_loss_layer.hpp

Merge pull request #5548 from erictzeng/crop

Rewrite crop layer GPU implementation

Merge pull request #5588 from ShaggO/matlab-fix-delete

Handling destruction of empty Net objects

Handling destruction of empty Net objects

Fix crop layer lint errors

Rewrite crop cuda kernel

Shape mismatch CHECK logging improvements

- More logs when shapes mismatch
- Manual reviewed all matches of “grep -r CHECK.*shape src”
- Follow JUnit convention of:
```
  CHECK(expected == actual)
      << “expected: “ << expected
      << “ vs. actual: ” << actual;
```

Layers:
- Recurrent
- BaseConvolutionLayer
- Slice (improves logging for incorrect parameter)

CHECK_EQ
- Would prefer to use CHECK_EQ(expected, actual):
https://github.com/google/glog/blob/master/src/glog/stl_logging.h.in#L36
- However this requires include of stl_logging.h which introduces a
build warning. I believe this would work if caffe was updated to the
latest version of glog but that's a bigger change.

Merge pull request #5530 from willyd/nccl-py3

Explicit std::string to bp::object conversion

Merge pull request #5539 from shelhamer/caffe-1.0

Caffe 1.0

Merge pull request #5536 from cypof/docker_cudnn6

Docker update to cuDNN 6

Merge pull request #5537 from shelhamer/docs-grooming

[docs] groom Caffe site

Merge pull request #5531 from shelhamer/py-test-layer-top-names

Test for python forward and backward with start and end layer

Merge pull request #5529 from shelhamer/deprecate-window

Deprecate WindowData layer type

Caffe 1.0

link to new full-day crash course

track publications by google scholar and not the wiki

retire caffe-dev and caffe-coldpress

dev has diffused into the community from the original Caffe core

add missing names to BAIR roster

model zoo: point out wiki link immediately, explain manual editing

favor notebook examples as more clear and popular

drop performance + hardware page and switch to sheet

simpler to read and update

BVLC -> BAIR

Berkeley AI Research (BAIR) is the the successor to
the Berkeley Vision and Learning Center (BVLC).

Docker update to cuDNN 6

fix lint errors that snuck in by #4566

Merge pull request #2612 from ih4cku/master

register a dummy reducer to prevent mincepie runtime error

Merge pull request #3410 from ghost/patch-2

sigmoid fix: calculate by tanh instead of exp (cpp)

Merge pull request #3411 from ghost/patch-3

sigmoid fix: calculate by tanh instead of exp (cpp)

Merge pull request #3153 from jeffdonahue/netspec-type-check

NetSpec: type-check Function inputs (they must be Top instances)

Merge pull request #3913 from antran89/master

minor fix to stochastic pooling and clean-up of mean computation

Merge pull request #3855 from shaibagon/upgrade_infogain

InfogainLoss layer can normalize, ignore, and more

[docs] added apt command to install OpenBLAS (#4718)