join: don't report disorder against an empty file

This allows one to use join as a field extractor like:
  join -a1 -o 1.3,1.1 - /dev/null

* src/join.c (join): Don't flag unpairable lines when
one of the files is empty.
* tests/misc/join: Add a new test for empty input, and adjust
a previous test that was only checking against empty input.
* doc/coreutils.texi (join invocation): Document the change.
* NEWS: Likewise.

join: ensure --header skips the order check with empty files

* src/join.c: Skip the header even if one of the files is empty.
* tests/misc/join: Add a test case.
* NEWS: Mention the fix

join: add -o 'auto' to output a constant number of fields per line

Lines with a different number of fields than the first line,
will be truncated or padded.

* src/join.c (prfields): A new function refactored from prjoin(),
to output all but the join field.
(prjoin): Don't swap line1 and line2 when line1 is blank
so that the padding is applied to the right place.
(main): Handle the -o 'auto' option.
* tests/misc/join: Add 6 new cases to test the auto format.
* NEWS: Mention the change in behavior.
Suggestion from Assaf Gordon

tests: remove obsolete uses of "$$" in temporary file names

Those were useful when tests might have been run in the same
directory and in parallel.  Now, each test is run in a newly-
created empty directory.
* tests/cp/backup-1: Remove obsolete uses of "$$".
* tests/cp/same-file: Likewise.
* tests/dd/misc: Likewise.
* tests/mv/part-symlink: Likewise.
* tests/mv/to-symlink: Likewise.
* tests/touch/fail-diag: Likewise.

tests: don't hide all trace of the vc_exe_in_TESTS test

There was a non-negligible delay after running a single test.
Now, you'll know why when you see this test's name.
* tests/check.mk (vc_exe_in_TESTS): Don't @-hide commands.
Use $(AM_V_GEN) instead.

tests: minor correction

* tests/du/move-dir-while-traversing: Ignoring SIGTSTP is enough;
don't also attempt to ignore SIGSTOP, it cannot be handled or ignored.
Spotted by Andreas Schwab.

tests: avoid FP failure due to suspension

* tests/du/move-dir-while-traversing: Prohibit suspension,
to avoid false-positive failure.

tests: avoid rare FP failure in new du test

* tests/du/move-dir-while-traversing: Create an even larger tree
to avoid a false-positive failure due to du terminating before
the rename is triggered.

split: avoid a new, spurious warning from gcc-4.6.0

* src/split.c (lines_rr) [IF_LINT]: Initialize files, now that
rawhide's gcc-4.6.0 would otherwise warn about use-uninitialized.

tail: avoid new diagnostic when applying -f to a pipe on linux-2.3.38

* src/tail.c (fremote): Do not print a diagnostic when
fstatfs (pipe_FD, &buf) fails, as it now does on linux-2.3.38.
This avoids the spurious failure of tests/misc/tail's f-pipe-1
test, when running in input-from-pipe mode.

doc: fix wording in warning about potential conflict with built-in

* doc/coreutils.texi (mayConflictWithShellBuiltIn): Fix wording.

manual: document floating point better

* doc/coreutils.texi (Floating point): New section.
(od invocation, tail invocation, sort invocation, printf invocation):
(sleep invocation, seq invocation): Refer and defer to it.  See
<http://lists.gnu.org/archive/html/bug-coreutils/2011-01/msg00031.html>.

build: update gnulib submodule to latest

The previous gnulib submodule reference was *still* to a
non-public commit.  My submodule had a stray commit, so
the reference was always to a local merge commit.
Reported by Rob Vermaas.

build: update gnulib submodule to latest

The previous gnulib submodule reference was to a non-public commit.
Reported by Rob Vermaas.

maint: use slightly more efficient process in README-release

* README-release: Run cheaper root-only tests first.
Use half of processing units (not just 1) for the expensive tests.

tests: avoid FP failure in new du test

* tests/du/move-dir-while-traversing: Create a larger tree to
avoid a false-positive failure due to du terminating before
the rename is triggered.

build: update gnulib submodule to latest

doc: update NEWS

* NEWS: Note when the uniq bug was introduced.
It was mine, commit 1d9b3de9, "uniq: remove redundant test".

doc: show how to shred more efficiently

* doc/coreutils.texi (shred invocation): Give an example showing how
to invoke shred in single-pass mode, and warn that -n0 --zero may
be inadequate.

uniq: replace a wasteful loop with simple calculation

* src/uniq.c (find_field): Remove the byte-skipping loop altogether.
Instead, perform the simple calculation.  This results in a 10%
performance improvement for large byte offsets.

tests: add a test for today's uniq bug

* tests/misc/uniq-perf: New file.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add it.

uniq: don't continue field processing after end of line

* NEWS (Bug fixes): Mention it.
* src/uniq.c (find_field): Stop processing loop when end of line
is reached.  Before this fix, 'uniq -f 10000000000 /etc/passwd'
would run for a very long time.

doc: specify how tr, echo, printf treat octal numbers

* doc/coreutils.texi (tr's Character sets): Document how a 9-bit
octal value is interpreted.  tr does not ignore the ninth bit.
(echo invocation, printf invocation): Document that any ninth
bit in \OOO is ignored. (http://debbugs.gnu.org/7574)

maint: refactor to use read-file from gnulib

* bootstrap.conf: Add the read-file module
* src/ptx.c: Replace the original code which would
needlessly read SIZE_MAX bytes of files larger than this.
* src/shuf.c: Replace the original code.

maint: trivial system header file cleanups

* src/system.h: Note where it should be included, and
make ordering check portable to GLIBC > 2
* src/copy.c: Move <sys/ioctl.h> along with other system headers
as is done elsewhere.
* src/install.c: Move <sys/wait.h> along with other system headers
as is done elsewhere.
* src/ptx.c: Include <regex.h> rather than "regex.h" as
is done elsewhere.  Note <regex.h> is kept after "system.h"
as per commit dba300a0.

doc: clean up HACKING guidelines

* HACKING: Remove mention of "indent-tabs-mode: nil", since
we've remove all of those directives.  No longer needed.
Remove dated (pre-emacs-23) reference regarding WhiteSpace mode.

gnulib: Also use dtoastr and ldtoastr modules.
This adjusts to the recent splitting of the ftoastr module into 3
<http://lists.gnu.org/archive/html/bug-gnulib/2011-01/msg00199.html>.
* bootstrap.conf (gnulib_modules): Add dtoastr, ldtoastr,
as coreutils needs all 3 modules now.

build: update gnulib submodule to latest

rm: ignore errno related to invalid file names

* src/remove.c (nonexistent_file_errno): Also skip EINVAL and
EILSEQ, for at least smbfs rejection of '*' in file names.
* NEWS: Mention the fix.

build: update gnulib submodule to latest

du: don't abort when a subdir is renamed during traversal

* NEWS (Bug fixes): Mention it.
* src/du.c (prev_level): Move declaration "up" to file-scope global.
(du_files): Reset prev_level to 0 upon abnormal fts_read termination.
Reported by Johathan Nieder in http://bugs.debian.org/609049
Also, improve a diagnostic.
* tests/du/move-dir-while-traversing: Test for the above.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add it.

maint: suppress some clang scan-build warnings

* src/pr.c (char_to_clump): Remove a dead store.
* src/remove.c (fts_skip_tree): Likewise.
* src/sort.c (key_warnings): Likewise.
(sort): Suppress an uninitialized pointer warning.

maint: replace uses of ignore_ptr with ignore_value

* gnulib: Update for enhanced ignore_value()
* src/chcon.c (process_file): Don't use the deprecated ignore_ptr.
* src/chmod.c (process_file): Likewise.
* src/chown-core.c (change_file_owner): Likewise.

post-release administrivia

* NEWS: Add header line for next release.
* .prev-version: Record previous version.
* cfg.mk (old_NEWS_hash): Auto-update.

version 8.9

* NEWS: Record release date.

build: update gnulib to latest; portability fixes

maint: update all copyright year number ranges

Run "make update-copyright".

build: update gnulib for version-etc copyright year update

* tests/sample-test: Update copyright to 2011, to appease syntax-check.

maint: generate much of the THANKS file

Before this change, we had a tendency to manually list each
contributor's name in THANKS.  Now, each commit "Author" is
included in the generated THANKS file automatically, and most
of the old THANKS file is now a template, THANKS.in.
We'll still have to manually list the names of people who report
problems without a usable patch.

* THANKS.in: New file, derived from THANKS, but removing names of
those who are listed as git log 'Author:'s.
* THANKS: Remove file.
* thanks-gen: New file.
* Makefile.am (THANKS): New rule.
(EXTRA_DIST): Add .mailmap, THANKS.in and thanks-gen.
* .gitignore: Add THANKS and THANKS-to-translators.
* .mailmap: Unify on single address and name-spelling per contributor.

maint: update to latest gnulib, for testsuite improvement

* gnulib: Update to latest for init.sh fix.
* bootstrap: Resync from gnulib.
* tests/init.sh: Likewise.

maint: allow gettext 0.17 again

Commit 041c9c47 traded the 'gettext' module for the lighter 'gettext-h'
module, so as to not require the latest gettext release (we only need
the latest release if we ship gettext as a dependent library, but
coreutils has long preferred to use it as an external library).
But that commit overlooked two places necessary to allow the use of
gettext 0.17.

This does not force you to downgrade (using gettext 0.18.1.1 is still
just fine), nor does it affect tarballs (once a tarball is built
with a given gettext version, it can be built on other machines
regardless of what gettext version is present).

* bootstrap.conf (buildreq): Relax prerequisite.
* configure.ac (AM_GNU_GETTEXT_VERSION): Likewise.

split: fix the suffix length calculation

* src/split.c (set_suffix_length): Only auto-calculate
the suffix length when the number of files is specified.
* tests/misc/split-a: Add a case to trigger the bug,
and exercise the suffix length auto-calculation.
* NEWS: Mention the fix.
Reported by Dmitry V. Levin and Sergey Vlasov at
https://bugzilla.altlinux.org/show_bug.cgi?id=24841

coreutils: keep lines within 80-column limits

* cfg.mk (LINE_LEN_MAX, FILTER_LONG_LINES): New macros.
(sc_long_lines): New rule.
* HACKING: Use shorter URLs to the same material.
* doc/Makefile.am, doc/coreutils.texi, m4/boottime.m4:
* man/help2man, man/stdbuf.x, src/Makefile.am, src/cat.c, src/copy.c:
* src/cp.c, src/dd.c, src/df.c, src/du.c, src/groups.c, src/install.c:
* src/ls.c, src/md5sum.c, src/mv.c, src/od.c, src/pinky.c, src/ptx.c:
* src/readlink.c, src/remove.c, src/rmdir.c, src/setuidgid.c:
* src/sort.c, src/tail.c, src/touch.c, tests/Coreutils.pm:
* tests/cp/existing-perm-race, tests/cp/perm, tests/cp/preserve-gid:
* tests/du/2g, tests/du/long-from-unreadable, tests/init.sh:
* tests/install/basic-1, tests/ls/nameless-uid:
* tests/ls/readdir-mountpoint-inode, tests/misc/chroot-credentials:
* tests/misc/cut, tests/misc/date, tests/misc/join, tests/misc/md5sum:
* tests/misc/sha1sum, tests/misc/sha224sum, tests/misc/sort:
* tests/misc/sort-continue, tests/misc/sort-files0-from:
* tests/misc/sort-rand, tests/misc/stdbuf, tests/misc/tr:
* tests/misc/uniq, tests/mv/atomic, tests/mv/part-fail:
* tests/mv/part-symlink, tests/mv/sticky-to-xpart, tests/pr/pr-tests:
* tests/rm/fail-2eperm, tests/rm/interactive-always:
Reformat to fit within 80 columns.
* doc/Makefile.am (BAD_POSIX_PERL): New macro.
* doc/coreutils.texi: Reword slightly, to make menus and
index lines shorter.
* src/md5sum.c: Redo --help output so that it fits within 79
columns, since that's a bit more portable and all the other --help
strings fit in 79 columns.

maint: avoid syntax-check failure due to unused #include

* src/getlimits.c: Don't include "c-ctype.h"; no longer used.

csplit: diagnose file counter wraparound

* src/csplit.c (create_output_file): Detect overflow when the
file counter wraps around, and exit with a diagnostic.  Formerly
the code silently wrapped around and wrote to the wrong file,
losing output data.

sort: minor performance tweak with num_processors

* src/sort.c (main): Don't invoke num_processors twice.

getlimits: port to hosts with very wide int, or non-ASCII

* src/getlimits.c (decimal_ascii_add): Remove, replacing with ...
(decimal_absval_add_one): New function, with different signature,
which does not assume ASCII.  All callers changed.
(print_int): Remove assumptions that integers fit in 206 bits, and
that characters are ASCII.  These assumptions are portable in
practice but are easy to remove here.

post-release administrivia

* NEWS: Add header line for next release.
* .prev-version: Record previous version.
* cfg.mk (old_NEWS_hash): Auto-update.

version 8.8

* NEWS: Record release date.

csplit: update gnulib for Solaris 8,9 snprintf fix

maint: correct test-related comments

* tests/mv/i-3: Adjust comment to match just-changed code.
Spotted by Pádraig Brady.
* tests/init.cfg (retry_delay_): Correct spelling of function name
in usage example.

tests: adjust preceding change to handle general WERROR_CFLAGS values

* gnulib-tests/Makefile.am (test_xvasprintf_CFLAGS):
(test_lock_CFLAGS, test_tls_CFLAGS): Avoid a syntax error when
$(WERROR_CFLAGS) expands to more than one token.

tests: do not assume compiler knows -Wxxx flags

* gnulib-tests/Makefile.am (test_xvasprintf_CFLAGS):
(test_lock_CFLAGS, test_tls_CFLAGS): Do not append GCC-specific
flags like -Wno-format-security unless the GCC-specific flag
-Werror is also specified.  This avoids a "make check" failure on
Solaris when using Sun C 5.8.

tests: mv/i-3: avoid false-positive failure on a slow/busy system

* tests/mv/i-3: Quadruple the timeout duration.
Without this, I saw an expired timeout on a heavily-loaded system.

tests: avoid new false-positive failure on at least FreeBSD 8.1

* tests/mv/trailing-slash: Accommodate different diagnostic
on FreeBSD 8.1.

who: omit useless definitions of MAXHOSTNAMELEN

This prevents a compilation failure on Solaris 8, GCC 4.4.2, with
"configure --enable-gcc-warnings".
* src/who.c (MAXHOSTNAMELEN): Remove; no longer needed.
* src/pinky.c: Likewise.

maint: fix a typo in sort --parallel help message

Also fix up Chen Guo's contacts
* src/sort.c (usage): Add a missing "of"
* THANKS: Add Chen Guo
* .mailmap: Add Chen Guo's UCLA address

build: update gnulib: ACL-vs-Solaris 8 portability etc.

tests: sync init.sh from gnulib

* tests/init.sh (setup_): Initialize fail=0 before invoking mktempd_.
Ensure that IFS is defined initially.
(mktempd_): Remove fail=0 initialization; no longer needed.

wc: fix a possible hang with --files0-from

* src/wc.c (main): exit when we get a read error on
the --files0-from file, rather than retrying and
spinning the CPU

cp: ensure backups are created when -T specified

* src/cp.c (do_copy): When -T is specified, initialize
the NEW_DST and SB variables, which are checked when
running: cp -T --force --backup file file
* tests/cp/backup-1: Add the -T case

sort: use at most 8 threads by default

* src/sort.c (main): If --parallel isn't specified,
restrict the number of threads to 8 by default.
If the --parallel option is specified, then
allow any number of threads to be set, independent
of the number of processors on the system.
* doc/coreutils.texi (sort invocation): Document the changes
to determining the number of threads to use.
Mention the memory overhead when using multiple threads.
* tests/misc/sort-spinlock-abuse: Allow single core
systems that support pthreads.
* tests/misc/sort-stale-thread-mem: Likewise.
* tests/misc/sort-unique-segv: Likewise.
* NEWS: Mention the change in behaviour.

doc: split: add examples showing how to use the new option

* doc/coreutils.texi (split invocation): Add examples.

tests: avoid spurious du/bigtime failure

* tests/du/bigtime: Map nonzero block count to 0.
Reported by Assaf Gordon.
* THANKS: Update.

tests: set fail=0 by default

* tests/init.sh (setup_): Set fail=0.  This was the intent as per
<http://lists.gnu.org/archive/html/bug-coreutils/2010-12/msg00058.html>
but the assignment in mktempd_ is ineffective, since mktempd_
is used inside `` and its assignments are in a subshell.

build: update gnulib submodule to latest

sort: do not generate thousands of subprocesses for 16-way merge

Without this change, tests/misc/sort-compress-hang would consume
more than 10,000 process slots on my RHEL 5.5 x86-64 server,
making it likely for other applications to fail due to lack of
process slots.  With this change, the same benchmark causes 'sort'
to consume at most 19 process slots.  The change also improved
wall-clock time by 2% and user+system time by 14% on that benchmark.
* NEWS: Document this.
* src/sort.c (MAX_PROCS_BEFORE_REAP): Remove.
(reap_exited): Renamed from reap_some; this is a more accurate name,
since "some" incorrectly implies that it reaps at least one process.
All uses changed.
(reap_some): New function: it *does* reap at least one process.
(pipe_fork): Do not allow more than NMERGE + 2 subprocesses.
(mergefps, sort): Omit check for exited processes: no longer needed,
and anyway the code consumed too much CPU per line when 2 < nprocs.

sort: fix hang with sort --compress

* NEWS: Document this.
* src/sort.c (UNCOMPRESSED, UNREAPED, REAPED): New constants.
(struct tempnode): New member 'state', to hold these constants.
The pid member is now undefined if state == UNCOMPRESSED.
(struct sortfile): Replace member 'pid' with member 'temp'.
(uintptr): Remove.
(proctab_hasher, proctab_comparator, register_proc, delete_proc):
Proctab entries are now struct tempnode *, not pid_t, to handle
the case where multiple tempnode objects correspond to the same
pid.  This avoids a race condition that can cause a hang.
(register_proc): Arg is now struct tempnode *, not pid_t.  All
callers changed.
(delete_proc): Set tempnode state to REAPED.
(create_temp_file): No need to set pid member here; it's now
done when the pid is known.
(maybe_create_temp, create_temp): Remove PPID arg.  Return struct
tempnode *, not char *.  All callers changed.
(maybe_create_temp): Set node state to UNCOMPRESSED or UNREAPED.
No need to set node->pid to 0.
(open_temp): Replace NAME and PID args with a single TEMP arg.
All callers changed.  Wait only for unreaped children.
(zaptemp): Wait for decompressor to finish before removing its
temporary-file input.  This avoids .nfsXXXX hassles with NFS
and fixes a race (leading to a hang) regardless of NFS.
(open_input_files): Adjust to new way of dealing with temp files
and their subprocesses.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add misc/sort-compress-hang.
* tests/misc/sort-compress-hang: New file.

sort: don't dump core when merging from input twice

* NEWS: Document this.
* src/sort.c (avoid_trashing_input): The previous fix to this
function didn't fix all the problems with this code.  Replace it
with something simpler: just copy the input file.  This doesn't
change the number of files, so return void instead of the updated
file count.  Caller changed.
* tests/misc/sort-merge-fdlimit: Test for the bug.

doc: tail: semi-deprecate --sleep-interval and --max-unchanged-stats

Those options are useful only on systems that lack inotify support
and in the unusual event that a system with inotify support must
resort to polling.
* src/tail.c (usage): Note that the --max-unchanged-stats=N and
--sleep-interval=N options are rarely useful on systems with
inotify support.
* doc/coreutils.texi (tail invocation): Likewise.

sort: fix very-unlikely buffer overrun when merging to input file

* src/sort.c (avoid_trashing_input): Fix a typo that could cause a
buffer overrun in theory.  In practice this is extremely unlikely,
as it requires running out of file descriptors in a small merge,
presumably because some other process is hogging all the OS's file
descriptors.

sort: document --compress reaper fixes

* NEWS: Document the --compress reaper fixes installed yesterday.

tests: default to /tmp as the temporary directory

* tests/check.mk (TESTS_ENVIRONMENT): Default TMPDIR to /tmp,
rather than to the working directory; this is more common in
practice, which makes the tests more real-worldish; and it is
often faster.  Also, it avoids some problems with NFS cleanups.
* tests/misc/sort-compress: Remove unnecessary code setting TMPDIR.
* tests/misc/sort-compress-proc: Likewise.  Do the final sleep
only if TMPDIR is relative, which should be rarely given the
change to TESTS_ENVIRONMENT.

sort: fix some --compress reaper bugs

* src/sort.c (uintptr): New type.
(enum procstate, struct procnode, update_proc): Remove.
(proctab_hasher, proctab_comparator, register_proc, wait_proc):
(reap_some): The proctab is now simply a hash of process-IDs
rather than of pointers to objects with reference counts and
states; this is smaller and faster and easier to understand.
(nprocs): Now pid_t, not size_t, since one cannot have more than
PID_MAX children.
(reap): If the argument is -1, wait; if 0 (a new value), do not.
Delete pid from proctab as needed.  Ignore children that are not
in proctab, as they are from the program that exec'ed us and are
irrelevant to our success or failure.
(delete_proc, reap_all): New functions.
(open_temp): Register the child.
(sort): Clean up all children afterwards; without this patch,
'sort' sometimes missed failures in children due to race conditions.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add misc/sort-compress-proc.
* tests/misc/sort-compress-proc: New file, to test for the
bugs fixed above.

tests: typo fix

* tests/misc/sort-stale-thread-mem: Fix typo in comment.

tests: tweak basic-1 to use warn_ rather than literal "exit 77"

* tests/install/basic-1 (just_built_dd): Use warn_, rather than
cat and exit 77.

tests: mark new test as very expensive

* tests/misc/sort-stale-thread-mem: Don't initialize fail=0 here;
that is done in init.sh.  This avoids a syntax-check failure.
Invoke "Exit $fail" at end, too.
Mark as a very expensive test.

tests: test for access to stale thread memory

* tests/misc/sort-stale-thread-mem: New tests.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add it.

tests: avoid FP failure when run under valgrind

* tests/misc/printenv: Filter out LD_PRELOAD, as the comment
said, not LD_LIBRARY.

sort: avoid segfault when using two or more threads

This change does not fix the actual bug.  That was done by commit
c9db0ac6, "sort: preallocate merge tree nodes to heap".  The fix
was to store each "node" structure on the heap, not on the stack.
Otherwise, a node from one thread's stack could be used in another
thread after the first thread had expired (via pthread_join).
This bug was very hard to trigger when using spinlocks, but
easier once we began using mutexes.
* NEWS (Bug fixes): Mention it.
For details, see http://debbugs.gnu.org/7597.

sort: syntax cleanup

* src/sort.c (xfopen, debug_key, sortlines, sort, main): Adjust
formatting: fix misplaced braces, use consistent spacing,
split a 2-stmt line.

sort: integer overflow checks in thread counts, etc.

* src/sort.c (specify_nthreads, merge_tree_init, init_node):
(queue_init, sortlines, struct thread_args, sort, main):
Use size_t, not unsigned long int, for thread counts, since thread
counts are now used to compute sizes.
(specify_nthreads): Check for size_t overflow.
(merge_tree_init, sort): Shorten name of local variable, for
readability.
(merge_tree_init): Move constants next to each other in product,
so that the constant folding is easier to see.
(init_node): Now static.  Add 'restrict' only where it might
be helpful for compiler optimization.
(queue_init): 2nd arg is now nthreads, not "reserve", which is
a bit harder to follow.  All uses changed.
(struct thread_args): Rename lo_child to is_lo_child, so that
it's obvious to the reader when we're talking about this boolean
as opposed to the new lo_child member of the other structure.
All uses changed.
(sort): Remove unused local variable end_node.
(main): Don't allow large thread counts to cause undefined behavior
later, due to integer overflow.

sort: preallocate merge tree nodes to heap.

* src/sort.c: (merge_tree_init) New function. Allocates memory for
merge tree nodes.
(merge_tree_destory) New function.
(init_node) New function.
(sortlines) Refactor node creation code to init_node. Remove now
superfluous arguments. All callers changed.
(sort) Initialize/destory merge tree. Refactor root node creation
to merge_tree_init.

sort: comment fix

* src/sort.c: Comment fix re spin locks.

sort: use mutexes, not spinlocks (avoid busy loop on blocked output)

Running a command like this on a multi-core system
  sort < big-file | less
would peg all processors at near 100% utilization.
* src/sort.c: (struct merge_node) Change member lock to mutex.
All uses changed.
* tests/Makefile.am (XFAIL_TESTS): Remove definition, now that
this test passes once again.  I.e., the sort-spinlock-abuse test
no longer fails.
* NEWS (Bug reports): Mention this.
Reported by DJ Lucas in http://debbugs.gnu.org/7489.

split: fix a case where --elide-empty causes invalid chunking

When -n l/N is used and long lines are present that both
span partitions and multiple buffers, one would get
inconsistent chunk sizes.

* src/split.c (main): Add a new undocumented ---io-blksize option
to support full testing with varied buffer sizes.
(cwrite): Refactor most handling of --elide-empty to here.
(bytes_split): Remove handling of --elide-empty.
(lines_chunk_split): Likewise.  The specific issue here
was the first handling of elide_empty_files interfered
with the replenishing of the input buffer.
* test/misc/split-lchunk: Add -e and the new ---io-blksize
combinations to the test.

tests: remove useless definition of $SORT in sort-compress

* tests/misc/sort-compress (SORT): Remove unused definition.

tests: make it harder to lose a race in spinlock-abuse

* tests/misc/sort-spinlock-abuse: On a busy system, with only 12
pauses of length 0.1 seconds, the buggy (busy-spinlock blocked)
sort would fail to accumulate 1 second of CPU time, and hence
would mistakenly pass.  Increase from 12 to 50.

sort: merge_queue -> queue

* src/sort.c (struct thread_args, sortlines_thread, sortlines, sort):
Rename "merge_queue" to "queue", for consistency with other functions
that just use the name "queue" for these things.

sort: clarify queue_check_insert

* src/sort.c (queue_check_insert): Clarify body a bit, and remove
no-longer-needed comment.

sort: fix problems with merge node dest pointer

* src/sort.c (mergelines_node): Return void, not size_t.  All
callers changed.  Change *node->dest here, not in caller.
Do not change node->dest: it's not needed and could cause problems
on (mostly theoretical) hosts that do not allow adding integers to
null pointers.
(queue_check_insert_parent): Omit MERGED parameter; no longer needed.
All callers changed.

sort: simplify write_unique

* src/sort.c (write_unique): Simplify slightly so that there is
just one call to write_line, not two.

sort: put queue arg first

* src/sort.c (queue_check_insert, queue_check_insert_parent): Make
the queue arg first, for consistency with other functions such as
queue_insert that put the queue arg first.  Rename from
check_insert and update_parent, respectively.  All callers
changed.

sort: tune struct_merge_node slightly

* src/sort.c (struct merge_node): 'lock' is now the actual lock,
not a pointer to the lock; there's no need for indirection here.
Make 'level' unsigned int instead of size_t, since it is a
bit-shift count; also, move it next to a bool so that it's more
likely to take less space.  All uses changed.
(sortlines, sort): Spell out initialization instead of using an
initializer.  This makes the initializer a bit easier to understand,
and avoids unnecessary stores into the spin lock.

sort: Clarify comments

* src/sort.c: Improve comments a bit.

tests: cleanup rm -rf fails under NFS

This problem was observed on RHEL 5.5 x86-64 when running as a
client of a NetApp FAS2050.
* tests/cp/cp-mv-backup: Don't leave a file descriptor open to
a file in a directory that will be cleaned up with "rm -rf".
Under NFS, when the rm unlinks that file, it is instead renamed
to .nfsXXXX and then rm cannot remove the parent directory,
and the test fails.
* tests/cp/same-file: Likewise.

cp: fix bug with fine-grained src to nearby coarse-grained dest

The actual fix is in gnulib's lib/utimecmp.c.
* NEWS: Document fix.

build: update gnulib submodule to latest

sort: fix bug on 64-bit hosts with at least 32768 processors

* src/sort.c (MAX_MERGE): Avoid integer overflow when on a machine
with (say) 32-bit int and 64-bit size_t and when level == 15.
Without this fix, on such a machine with 32768 or more processors,
the level computation could overflow on large input, and this
would result in division by zero.

tests: add test for parallel sort -u segfault bug

* tests/misc/sort-unique-segv: New file.
* tests/Makefile.am (TESTS): Add it.