remove padding_layer and its test

unified to padding aware version

remove test code (no longer needed and won't compile)

remove padding layers in imagenet definitions

remove the pad=0 case in conv_layer and im2col_layer

add code to measure timing

add test code to test the padding aware im2col col2im functions

implemented padding aware im2col and col2im functions

Merge pull request #167 from BVLC/next

So be it.

Define split layer (merge trick)

Originally authored by Jeff Donahue, but this commit was needed for
historical reasons.

Merge pull request #129 from jeffdonahue/dags-by-split

Welcome to the model of forking paths.

minor cleanup; only get blob_name if needed

add idempotence test

add imagenet no split insertion test

fix split layer insertion bug with in-place layers

remove unnecessary include

eliminate some cruft by relying on std::map default initializations

get rid of messy snprintf string concatenation

get_split_blob_name returns a string to remove some verbosity

remove redundant add_bottom (immediately cleared and then re-added)

add test for layer with two tops that are inputs to multiple layers

fix comment typo

remove pointlessly duplicated CheckGradientExhaustive calls (I screwed
up when merging, I think)

change \" in test_split_layer to ' for readability

allow in place computation of SplitLayer 0th top blob

give first top split blob same name as bottom blob

change \n's to less distracting spaces in hard-coded proto strings

eliminate redundant code with get_split_blob_name method

some cleanup

add split layer insertion tests; move split insertion code to util file

add split layer tests

add split layer tests

make split_layer backward obey propagate_down

Merge pull request #116 from aravindhm/tanh

Added a test for the tanh layer.

Added tanh activation function layer.

Merge pull request #142 from shelhamer/data-aux

Sort out models, data, examples, and tools

bring imagenet docs back to reality

- fix paths
- replace shell command blocks with scripts
- file ipython notebooks in examples
- proofread

bring mnist docs back to reality

fix + rename lenet training script

harmonize imagenet example, name caffe reference model CaffeNet

fix mnist, add deploy net example

TODO cifar example

everything in its right place

include model checksum, you never know these days

fetch caffe_reference_imagenet_model

swap ilsvrc data with fetch script

explain ignore, and ignore data, models, and examples

Data, models, and examples should not be versioned by default. Reference
versions of these are not to be casually committed.

Plus this makes for a better playground in examples without having to
worry about data, intermediate files, or experiments being accidentally
tracked.

file models

fix mnist comments in cifar example

Make tools/ for core binaries, stow scripts/ in tools/extra

Collect core Caffe tools like train_net, device_query, etc. together in
tools/ and include helper scripts under tools/extra.

file mnist

add imagenet mean file

move imagenet splits + synsets to data

Merge pull request #164 from t-abe/fix-typo

Fix error message typo in SoftmaxWithLossLayer

Merge pull request #154 from sguada/leveldb_max_open_files

Set leveldb options.max_open_files = 100. Fix #13 and #38

minor README fix

More comments in Makefile.config.example

more instructions on how to contribute

Merge pull request #157 from sergeyk/master

Moving gh-pages stuff to docs/ directory, with script to build and deploy to gh-pages.

Updated README with doc info

Safer docs/ build process: into own folder

improved docs-building script

Moving gh-pages docs to docs/ folder, with script to build them

Properly index windows in detector list mode

Fix iteration over single windows: whether one or more windows are
listed for an image, generate windows as a list.

fix detector's coordinate mapping for images smaller than IMAGE_DIM

Merge pull request #123 from longjon/master

don't pass LDFLAGS when only performing compilation (-c)

Revert "Merge pull request #114 from jeffdonahue/dags-by-split"

Revert dags-by-split merge because split layers were not quite ready.
Sorry for the bug!

We are adopting a `master`/`dev` split development
model, where new commits and pull requests will be merged to `dev` for
testing before integration to `master`. This will keep master clean and
stable.

This reverts commit d339d242b43ec5bec9dceb657ee0d665d524b1eb, reversing
changes made to 55198262d79944fa7382868f7ecd108ed4f238a2.

don't pass LDFLAGS when only performing compilation (-c)

This simplifies the compiler commands and suppresses warnings.

add contributing guide

Merge pull request #114 from jeffdonahue/dags-by-split

Support arbitrary DAGs with SplitLayer

remove unnecessary include

eliminate some cruft by relying on std::map default initializations

get rid of messy snprintf string concatenation

get_split_blob_name returns a string to remove some verbosity

remove redundant add_bottom (immediately cleared and then re-added)

add test for layer with two tops that are inputs to multiple layers

fix comment typo

remove pointlessly duplicated CheckGradientExhaustive calls (I screwed
up when merging, I think)

change \" in test_split_layer to ' for readability

allow in place computation of SplitLayer 0th top blob

give first top split blob same name as bottom blob

change \n's to less distracting spaces in hard-coded proto strings

eliminate redundant code with get_split_blob_name method

some cleanup

add split layer insertion tests; move split insertion code to util file

add split layer tests

add split layer tests

make split_layer backward obey propagate_down

add SplitLayer and Net::AddSplits to transform shared bottom blobs into
split layers

define by := (no need for re-expansion)

python requirements: don't fear the future

add shebang to python scripts

for executing in the shell without call to python. Follows the example
of @kloudkl .

add macro for numpy < 1.7

as suggested by @longjon
https://github.com/BVLC/caffe/issues/44#issuecomment-32832810

Merge pull request #106 from tdomhan/sigmoidlayer

Sigmoidlayer

fixed copyright

sigmoid layer cpu and gpu code

added sigmoid layer

Merge pull request #104 from sergeyk/master

Groom detection demo notebook, replace gflags with argparse in detector.py