Fixing assert message for beta distribution (#16786)

python 2.7 unit test error repair on windows (#16725)

* python 2.7 unit test error repair on windows

* Fix lint error.

Add option to not include histograms (#16579)

* Add option to not include histograms

* Add test for model_summaries=False

Adds parameter 'msg' to tf.TensorFlowTestCase. (#16667)

This commit adds a msg parameter that defaults to None to the following
functions:
- assertProtoEquals
- assertArrayNear
- assertNDArrayNear
- assertAllClose
- assertAllEqual
- assertShapeEqual
- assertDeviceEqual

Fixes variable name (#16797)

* Fixes variable typo name

* fixes optional typo

* Fix typo

* fixes deallocations

* typo fix

* typo fix

* fixes variable name

* fixes param typo

* Fixes typo

* fix typo

* fixes

Update CONTRIBUTING.md (#16806)

* Update CONTRIBUTING.md

Edited a few grammar issues.

* Fix

Fix error message in record_reader (#16808)

Make configure script more lenient to the length of CUDA and cuDNN versions entered. (#16853)

Improve shape function of SampleDistortedBoundingBox and fix some test cases (#16870)

* Update test case to expose the issue of sample_distorted_bounding_box

This commit expoes the issue of sample_distorted_bounding_box,
as shape function does not check the ranking like inside Compute().

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Adjust shape to pass the test.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Improve shape function of SampleDistortedBoundingBox and fix some test cases

This fix tries to improve the shape function of SampleDistortedBoundingBox
and fix several test case issues.
As is shown in the kernel of SampleDistortedBoundingBox, the shape of
SampleDistortedBoundingBox are required to be 1-D `[height, width, channels]`
for image_size, 3-D with shape `[batch, N, 4]` for bounding_boxes.

In the test case, the uses shape is incorrect but becasue of no check in shape
function, the test case passes.

This fix adds the shape check for SampleDistortedBoundingBox, and
fixes the incorrect test cases.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Fix broken link in CONTRIBUTING.md (#16869)

This fix fixes the broken link in CONTRIBUTING.md.
Without `https://`, the markdown will render the link incorrectly to
https://github.com/tensorflow/tensorflow/blob/master/www.docker.com

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Fix static shape inference for keras.layers.LSTM (#15234)

* TST: add test case

* BUG: fix static shape inference

* TST: clean code

* BUG: support dims > 3

Enable some passes for graph_transform on Windows (#16121)

* Enable some passes for graph_transform on Windows

Don't know why but the following passes are disabled on Windows:

* quantize_weights
* quantize_nodes
* round_weights

This patch re-enabled them.

* Fix BUILD file in response to format checker

py_func convert unicode string results to bytes for python2 (#16322)

* TST: add test case

* BUG: allow unicode string for python 2

* DOC: revise doc

* Fix lint error

Add optimized gif support for decode_gif (#16804)

* Add optimized gif support for decode_gif

While revisiting the issue of 15838, I noticed that
currently optimized gif is not supported. However,
optimized gif is actually possible to be processed
as essentially the subsequent frame just adds
the content on top of the previous frame on canvas.

This fix adds the support for optimized gif with decode_gif.

As is shown in the added test case, optimized gif (`optimized.gif`)
could be handled the same way as original gif (`scan.gif`).

This fix fixes 15838.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Format gif_io.cc with clang-format -i --style=Google

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add test case to cover optimized gif support for decode_gif.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add `#include <algorithm>` to fix Windows build errors

This commit add `#include <algorithm>` to fix
build errors on Windows platform.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Add uint32 and uint64 kernel support for `Invert` (#15154)

* Add uint32 and uint64 kernel support for `Invert`

This fix adds uint32 and uint64 kernel support for `Invert`.

In bitwise_ops.cc, uint32 and uint64 have been registered
for `Invert` like other bitwise ops
`BitwiseAnd`/`BitwiseOr`/`BitwiseXor`/`LeftShift`/`RightShift`.
However, no uint32 and uint64 kernels available for `Invert` yet.

This fix add uint32 and uint64 kernel for `Invert`,
and adds additional test cases to cover the changes.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add test cases for uint32 and uint64 support with `Invert`

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add missing uint32 and uint64 in GPU for invert

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add DEFINE_UNARY8 for invert

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Support CopyFile with streaming (#12658)

* Support CopyFile with streaming

This fix tries to address the issue raised in 12641 where
it was not possible to have CopyFile with streaming. The original
implementation copies the whole content of the file to a string
buffer and write to the file. This could be an issue
if the file size is large (than memory of the host).

This fix streams the CopyFile operation.

This fix fixes 12641.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Use sendfile for CopyFile implementation in Linux

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Merge CopyFile for same fs and different fs

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* `sendfile64` -> `sendfile` to fix Android build

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Add sendfile processing for Darwin

This commit adds sendfile processing for OSX Darwin.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Not using sendfile in MacOSX

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Address review feedback

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Remove the size check and test OUT_OF_RANGE instead.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Small fixes

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>
* Rename CopyFile to FileSystemCopyFile to fix Windows build errors

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

resolve undefined name array_ops (#16485)

Fix document typo (#16489)

Fix undefined name: import as_str_any for line 35 (#16668)

flake8 testing of https://github.com/tensorflow/tensorflow on Python 2.7.14

$ __flake8 . --count --select=E901,E999,F821,F822,F823 --show-source --statistics__
```
./tensorflow/python/util/compat_internal.py:33:12: F821 undefined name 'as_str_any'
    path = as_str_any(path.__fspath__())
           ^
```

Fixed a typo in `group_by_window` documentation (#16711)

CMake (Windows): Added support for ninja build and some fixes/changes (#16763)

* Added support for ninja build and some fixes/changes in CMake for Windows

* Fixed typo

spelling fixes for contrib docs (#16811)

Remove obsolete BernoulliWithSigmoidProbs (#16846)

As was pointed out by 9485, BernoulliWithSigmoidProbs is covered
by Bernoulli and is obsolete. This fix removes BernoulliWithSigmoidProbs.

This fix closes 9485.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Fix typo (#16822)

Merge pull request #16837 from yongtang/16534-tf.losses.softmax_cross_entropy

Remove warnings in tf.losses.softmax_cross_entropy

Fixes issue when linking of rule '//tensorflow/contrib/lite/toco:toco… (#16838)

* Fixes issue when linking of rule '//tensorflow/contrib/lite/toco:toco' fails because LD_LIBRARY_PATH is not configured

* Check if LD_LIBRARY_PATH is in environ_cp

Bump JetPack default to 3.2 in Android build script (#16842)

Merge pull request #16844 from rmlarsen/master

Fix comparison in neon_depthwise_conv_op test.

Merge pull request #16819 from ankurtaly/branch_184768730

Branch 184768730

Fix bug and speed up Grappler constant folding

Fix bug in and speed up ConstantFolding::CreateNodeDef():
  * Fix bug trying to store more than kintmax32 values in a repeated proto field.
  * Speed up populating compressed format. Example: tensorflow/python/kernel_tests/large_concat_op_test with size = 2**29+6 goes from ~30 seconds to ~15 seconds. The fraction of time spent in ConstantFolding::CreateNodeDef() goes down from about 35% to about 12%.

Use assertAllClose instead of assertArrayNear.

assertArrayNear compares absolute instead of relative error. For floating point computation you want the latter.

Merge pull request #1 from tensorflow/master

merge from master

Update BUILD

Updated copyright from 2017 to 2018

Add unsortedsegment(prod/min/max/sqrt_n/mean). (#15858)

* Add unsortedsegment(prod/min/max/sqrt_n/mean).

This commit adds CPU/GPU implementations for prod/min/max
ops and python implementations for mean/sqrt_n. Also, it adapts and unifies the
corresponding tests of all unsorted reductions.
Note: The new gradient of unsorted_segment_max fixes the crash occuring when
negative indices on CPU are used.

* update golden API

* Fix compilation of atomicAdd for cuda_arch < 600. \n This commit moves the std::complex specialization of atomicAdd below the double specialization of atomicAdd for cuda_arch 600.

* Enable bfloat16, change inline to EIGEN_STRONG_INLINE.

* fix includes of cuda_device_functions; fix typo

Remove warnings in tf.losses.softmax_cross_entropy

This fix tries to address the issue raised in 16534 where
tf.losses.softmax_cross_entropy causes warnings due
to the calling of tf.nn.softmax_cross_entropy_with_logits.

This fix switches to tf.nn.softmax_cross_entropy_with_logits_v2
to remove the warning.

This fix fixes 16534.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Typo in variable name: BETA --> self.BETA (#16666)

__BETA__ is defined on line 118 as a class member so it can only be accessed via __self__ or via the __ElasticAverageOptimizer__.

flake8 testing of https://github.com/tensorflow/tensorflow

$ __flake8 . --count --select=E901,E999,F821,F822,F823 --show-source --statistics__
```
./tensorflow/contrib/opt/python/training/elastic_average_optimizer.py:153:27: F821 undefined name 'BETA'
      self._moving_rate = BETA / communication_period / num_worker
                          ^
```

Fix incorrect links in CONTRIBUTING.md (#16814)

This fix fixes two incorrect links in CONTRIBUTING.md
about license examples. The reason for broken links
is because tensorboard is in another repo.

Signed-off-by: Yong Tang <yong.tang.github@outlook.com>

Merge commit for internal changes

[tf.data] Fix a memory leak when an iterator is reinitialized many times in a session.

Previously, we would instantiate a new function handle for each
function in a dataset each time an iterator on that dataset was
initialized. These would only be deleted at session closure, which
could lead to an apparent leak of memory over the lifetime of session.

PiperOrigin-RevId: 184768730

Fix memory tracking in the case where temp memory is used as output memory.
Track all persistent memory allocation in allocate_persistent call except for variables and queues where persistent memory is tracked in variables ops and queue ops. Deallocation of persistent memory is ignored.

PiperOrigin-RevId: 184768231

Sync the opensource and non-opensource build

PiperOrigin-RevId: 184765632

Address Adagrad/RMSProp incompatibility with CudnnRNN

CudnnRNN layers have variables of unknown shapes, which Adagrad/RMSProp didn't handle before.

This fixes 6620(#6620).

PiperOrigin-RevId: 184759579

[XLA] Add and use new Literal::MakeTupleOwned overload.

Previously MakeTupleOwned was cumbersome to use, because you had to
explicitly materialize a vector<unique_ptr<Literal>>.  With this new
overload, you can pass unique_ptrs directly.

PiperOrigin-RevId: 184751119

Add read resource variable benchmarks.

Initial benchmarks:
entry {
  name: "MicroBenchmarks.benchmark_read_variable_op_2_by_2_CPU"
  iters: 30000
  wall_time: 22.9616721471
  extras {
    key: "examples_per_sec"
    value {
      double_value: 43550.8352176
    }
  }
}

entry {
  name: "MicroBenchmarks.benchmark_read_variable_op_with_tape_2_by_2_CPU"
  iters: 30000
  wall_time: 27.3616631826
  extras {
    key: "examples_per_sec"
    value {
      double_value: 36547.4859232
    }
  }
}

PiperOrigin-RevId: 184748548

Creates tf.contrib.feature_column module.

PiperOrigin-RevId: 184747924

Handles possible infinite recursion in while loop fix.

PiperOrigin-RevId: 184743192

[TF Ops] Bugfix to Operation initializer: error message uses node_def.

self.node_def may not yet be accessible when using the C api.

PiperOrigin-RevId: 184742074

Automated g4 rollback of changelist 184551259

PiperOrigin-RevId: 184738583

Export CXX11_ABI_FLAG and MONOLITHIC_BUILD constants.

PiperOrigin-RevId: 184736216

Another rolling back of performance regression.

PiperOrigin-RevId: 184734426

Make TFE_Py_FastpathExecute work for all types of ops

MatMul benchmarks:
entry {
  name: "MicroBenchmarks.benchmark_gen_math_ops_matmul_2_by_2_CPU"
  iters: 30000
  wall_time: 11.580435435
  extras {
    key: "examples_per_sec"
    value {
      double_value: 86352.538781
    }
  }
}

entry {
  name: "MicroBenchmarks.benchmark_tfe_py_fastpath_execute_matmul_2_by_2_CPU"
  iters: 30000
  wall_time: 7.02576637268
  extras {
    key: "examples_per_sec"
    value {
      double_value: 142333.227004
    }
  }
}

PiperOrigin-RevId: 184734289

Added support for nested functions
Properly handle the case of control dependencies

PiperOrigin-RevId: 184733444

Add utility function which makes implicit `tf.get_variable` dependencies an
explicit argument of a callable.

PiperOrigin-RevId: 184725878

Fixing the issue where an escape character was being included in the branch name changes.

PiperOrigin-RevId: 184725332

[TF:XLA] Bump open source llvm revision to r324323

PiperOrigin-RevId: 184725126

Fetch OpDefs from C API instead of using python op registry in ops.py.

PiperOrigin-RevId: 184723558

Fixed typo

PiperOrigin-RevId: 184721743

tfdbg: deflake session_debug_file_test

by disabling grappler in the test.

PiperOrigin-RevId: 184721353

Second, cleaner, attempt at external control dependency handling.

PiperOrigin-RevId: 184718016

Improve side_effect_guards to (1) avoid aliasing non-tensors and (2) combine aliasing with re-indenting. Move the renaming visitor into a generic utility API.
This loses potential efficiency by risking sequencing ops where there is no risk of a race. On the other hand it's still not entirely robust, and we need to raise an error where we can't guarantee that.

PiperOrigin-RevId: 184717456

Estimator should handle ResourceVariables correctly.

PiperOrigin-RevId: 184717305

Support resource variables in moving averages.

PiperOrigin-RevId: 184716895

Contrib estimator should handle ResourceVariables properly.

PiperOrigin-RevId: 184715896

Internal change

PiperOrigin-RevId: 184715822

Adding tf_export decorators/calls to TensorFlow functions and constants.

PiperOrigin-RevId: 184708277

Enable layout optimizer by default

PiperOrigin-RevId: 184707084

Merge pull request #16785 from av8ramit/merge_branch

Merging the 1.6 branch back into master.

Support training with model parallelism in tpu_estimator.

PiperOrigin-RevId: 184704902

Use the function name as the grappler item id

PiperOrigin-RevId: 184704131

remove write_version=saver_pb2.SaverDef.V1 (#15966)

Merge pull request #16789 from ManHyuk/fix_typo

Fix typo

Merge pull request #16792 from case540/branch_184622482

Branch 184622482

Add local interconnect data to DeviceLocality.

This information can be used within a distributed implementation
when deciding how to route data transfers that might involve more
than one hop.  By default the new fields are populated according to
StreamExecutor::CanEnablePeerAccessTo(), however a platform-specific
implementation can augment them with more detailed values.

Do some refactoring of gpu_device and gpu_device_factory, making
GetDeviceLocalities() and GetInterconnectMaps() into virtual
functions.

PiperOrigin-RevId: 184698821

Explicitly specify the value of all the attributes for the newly created Assign
nodes since we can't always rely on TF calling AddDefaultAttrsToGraphDef.

PiperOrigin-RevId: 184698463

Fix bug in and speed up ConstantFolding::CreateNodeDef():
  * Fix bug trying to store more than kintmax32 values in a repeated proto field.
  * Speed up populating compressed format. Example: tensorflow/python/kernel_tests/large_concat_op_test with size = 2**29+6 goes from ~30 seconds to ~15 seconds. The fraction of time spent in ConstantFolding::CreateNodeDef() goes down from about 35% to about 12%.

PiperOrigin-RevId: 184693749

Add a utility function to partition TensorFlow Lite graphs into subgraphs.

This will be used for the forthcoming delegate interface. The delegate
interface will allow parts of the TensorFlow lite graph to be sent to
other accelerators. NNAPI will be implemented to move to this interface.
That will allow partial delegation to NNAPI.

PiperOrigin-RevId: 184692126

Java: Update to 1.6.0-rc0

PiperOrigin-RevId: 184687994

Make namedtuples with identical name and field names to be considered as the same shallow structure in assert_shallow_structure

PiperOrigin-RevId: 184687609

Remove redundant calls to realloc dynamic tensors.

PiperOrigin-RevId: 184682942

Makes ResourceVariables return correct initialized_value and initial_value for objects created from VariableDef protos.

Previously self._initial_value wasn't set in such cases which causes accessing var.initial_value to fail for variables in the imported meta graphs.

PiperOrigin-RevId: 184657191

mcmc_diagnostics.py added to contrib/bayesflow/.  potential_scale_reduction function added.
.

PiperOrigin-RevId: 184644450

Rollback of CL 183879566, and fix Windows CMAKE build by copying one additional CUDA header file.

PiperOrigin-RevId: 184644220

Merge commit for internal changes

Export align_corners to TF Lite

PiperOrigin-RevId: 184622482

Added the ability to query the amount of RAM available
Also added the ability to query the CPU frequency on Windows.

PiperOrigin-RevId: 184620390

Cleanup markdown errors in `Bijector`.

PiperOrigin-RevId: 184616392

[XLA] Add HloBindings::ToString().

PiperOrigin-RevId: 184615306

Correctly treat "devices=/gpu:0" argument of replicate_model_fn.

At the moment if "devices=/GPU:0" are specified by the user, then variables are going to be placed on the GPU.  However, if "devices=/gpu:0" are given, then they are going to be placed on the CPU.  Instead, the latter case should be equivalent to the former case.

PiperOrigin-RevId: 184612823

Misc cleanups and tweaks:
1. Removed obsolete constructors in ProcessLunctionLibraryRuntime
2. Add const annotations to Tensor::PrintOneDim(), and removed unnecessary vector copy.

PiperOrigin-RevId: 184611531

[XLA:GPU] Split IrEmitter{Unn,N}ested out of ir_emitter.h.

Also add a bunch of clarifying comments.

PiperOrigin-RevId: 184610674

Merge branch 'master' of https://github.com/tensorflow/tensorflow into fix_typo

fix typo

Support negative axis in concatenation

PiperOrigin-RevId: 184605786

Shard linear operator tests.

PiperOrigin-RevId: 184602704

Fix the mean the description of the output shape, which should be [batch_size, 1, max_time] (#16642)

Remove invalid exception in linear operator (#16678)

Add filepaths to test_local support.

PiperOrigin-RevId: 184602010

Remove makefile build dependency on all_opensource_files, as part of the effort to remove all_opensource_files #15758.

PiperOrigin-RevId: 184601439

Bump the rtol in hmc_test (#16787)