Merge remote-tracking branch 'upstream/3.4' into merge-3.4

Merge pull request #14071 from alalek:cmake_remove_unreferenced_functions

Merge pull request #14059 from alalek:imgcodecs_disable_jasper

Merge pull request #14057 from alalek:fix_libtiff_build

cmake: clean unreferenced functions from OpenCV modules too

Merge pull request #14070 from zuoshaobo:my3.4

fix the region layer's output anchor size  normalization error

Merge pull request #14068 from alalek:fix_python_standalone_build

python: update CMake install rules

imgcodecs: OPENCV_IO_ENABLE_JASPER runtime parameter

3rdparty: fix libtiff build

Keep `_FILE_OFFSET_BITS` undefined in Android builds.

Merge pull request #14050 from npochhi:mlp_ann_eps_change

Merge pull request #14051 from LaurentBerger:i14047

Merge pull request #14048 from alalek:issue_13522

Merge pull request #14054 from mshabunin:fix-dc1394

Merge pull request #14040 from seiko2plus:issue13211

Removed obsolete functions from cap_dc1394_v2.cpp

Changed eps checking condition

core:vsx working around gcc aligned memory access bug

 - allow cmake to check sanity of vsx aligned ld/st
 - force universal intrinsics v_load_aligned/v_store_aligned
   to failback to unaligned ld/st if cmake runtime vsx aligned test fail

Issue 14047

Merge remote-tracking branch 'upstream/3.4' into merge-3.4

android: don't install java/build.gradle

Merge pull request #13655 from sturkmen72:update_doc_photo

Merge pull request #13695 from flyingfalling:3.4

* Fixed bug that made cuda::filter give corrupted output when different filters called in different threads. This was due to use of global texture variable shared by all filters.

* REV: fixed tab issue for opencv coding style...

Merge pull request #14045 from rpici:fix_bug_in_test_tiff

Merge pull request #14021 from dkurt:init_opencv_wasm

Merge pull request #14046 from alalek:fix_static_analysis_issues_3.4

Merge pull request #14043 from alalek:revert_13843

Fix bug in test_tiff.cpp

The big endian data in the tiff_sample_data array was never being tested.  This could be observed by e.g. changing the 9th byte in the big endian data from 0xde to something that should fail the test, e.g. 0xdd, and the test would still pass even though it should fail.

fix static analysis issues

Merge pull request #14041 from nglee:dev_cudaarithmLUTPtr

imgproc: revert #13843

This reverts commit 00e8c7810fa83b1545d985601058a56e1c5bcd89

Move Ptr-related code from lut.cu to lut.cpp

Backport commits from
https://github.com/opencv/opencv/pull/12601
https://github.com/opencv/opencv/pull/12622

Merge pull request #14029 from LaurentBerger:creategrid

Merge pull request #14036 from jveitchmichaelis:Y16_v4l_fix

Merge pull request #14038 from alalek:update_version_3.4.6-pre

Merge pull request #14037 from alalek:update_version_4.1.0-pre

release frame after disabling convert rgb

pre: OpenCV 3.4.6 (version++)

pre: OpenCV 4.1.0 (version++)

Tutorial create pattern grid for calibration using gen_pattern.py

Merge remote-tracking branch 'upstream/3.4' into merge-3.4

Merge pull request #14013 from alalek:imgproc_dispatch_filter

Merge pull request #14011 from komakai:debug-build

* Add Android SDK debug build flag

* Change LOG_TAG define for consistency with other modules

imgproc: dispatch morph

imgproc: dispatch box_filter

imgproc: dispatch bilateral_filter

imgproc: dispatch smooth

imgproc: dispatch medianBlur

imgproc: get rid of filter.avx2.cpp

imgproc: dispatch filter.cpp

imgproc: keep history of filters files

imgproc: copy .dispatch.cpp

imgproc: copy .simd.hpp

Merge pull request #14022 from alalek:core_fix_neon_intrinsics

core(intrin): NEON v_load_expand_q() support unaligned addr

Merge pull request #14015 from saskatchewancatch:issue-13921

Merge pull request #13847 from ghellwig:jpeg2000-compression-flag

Add onRuntimeInitialized for opencv.js

Add JPEG2000 compression flag.

Merge pull request #13956 from komakai:java-mat-class-improvements

* Expose more C++ functionality in the Java wrapper of the Mat class
In particular expose methods for handling Mat with more than 2 dimensions
* add constructors taking an array of dimension sizes
* add constructor taking an existing Mat and an array of Ranges
* add override of the create method taking an array of dimension sizes
* add overrides of the ones and zeros methods taking an array of dimension sizes
* add override of the submat method taking an array of ranges
* add overrides of put and get taking arrays of indices
* add wrapper for copySize method
* fix crash in the JNI wrapper of the reshape(int cn, int[] newshape) method
* add test for each method added to Mat.java

* Fix broken test

issue-13921: Support setting compression setting for writing tiff images

Merge pull request #13997 from alalek:imgproc_dispatch_cvtcolor

Merge pull request #14000 from nglee:dev_FixCuda101BuildIssueMaster

Merge pull request #13999 from addyi:fixAndroidLintingErrors

* fix android lint error in BaseLoaderCallback (LongLogTag)

Lint Error that was causde by the to long TAG:
BaseLoaderCallback.java:31:
Error: The logging tag can be at most 23 characters,
was 31 (OpenCVLoader/BaseLoaderCallback) [LongLogTag]
Log.e(TAG, "Package installation failed!");

* add requested "OCV" prefix for android logging

Merge pull request #13875 from allnes:optimization_fuse

Merge pull request #13937 from smirnov-alexey:gapi_change_standalone_cmake

CUDA 10.1 Build Issue Fix on Master Branch

imgproc: dispatch color*

Lab/XYZ modes have been postponed (color_lab.cpp):
- need to split code for tables initialization and for pixels processing first
- no significant performance improvements for switching between SSE42 / AVX2 code generation

core: keep history of color*.cpp

imgproc: clone color*.dispatch.cpp

imgproc: clone color*.simd.hpp

Merge pull request #13979 from alalek:issue_13772

Merge pull request #13986 from alalek:perf_ignore_ovx

Merge pull request #13993 from liuyuns:issue_13963_thresh_nms_yolov3

Add ability to read thresh and nms_threshold from YOLO layer in YOLOV3 cfg file.

Currently the thresh is hard-coded to be 0.2 and nms_threshold as 0.4.

Merge pull request #13988 from raymanfx:gstreamer

videoio: gst: Fix gst assertion on null msg

According to the gstreamer docs [1], the GstMessage pointer returned by
gst_bus_pop() is nullable, meaning NULL is a valid return value.

Previously, gst_is_missing_plugin_message would throw an assert when its
message object parameter would fail the GST_IS_MESSAGE macro check,
crashing the entire process (unless running in a try-catch block of course).

Instead of relying on valid messages, check if the message object itself is
valid before passing it to other gstreamer functions.

[1] https://gstreamer.freedesktop.org/data/doc/gstreamer/head/gstreamer/html/GstBus.html#gst-bus-pop

Signed-off-by: Christopher N. Hesse <raymanfx@gmail.com>

perf: ignore _ovx tests

Merge remote-tracking branch 'upstream/3.4' into merge-3.4

Added optimization fuse

Merge pull request #13880 from catree:add_hand_eye_calibration

Merge pull request #13980 from terfendail:bresize3_fix

Merge pull request #13962 from Christianwidjaya:master

Merge pull request #13953 from saskatchewancatch:patch-1

Merge pull request #13974 from alalek:fix_build_warnings

Fixed out of bound reading in LINEAR_EXACT resize for 8UC3

Add Hand-Eye calibration methods (Tsai, Park, Horaud, Andreff, Daniilidis).

core: fix condition in OutputArray::create(allowTransposed=True)

Merge pull request #13967 from alalek:backport_android_build_py

Merge pull request #13945 from alalek:backport_bindings_generator

Merge pull request #13970 from alalek:videoio_plugins_update

build: fix warnings

Need -DBUILD_DOCS CMake flag to build docs

Must have that flag. Otherwise following "doxygen overview" tutorial won't work.

cmake: support MSVS 2019

Merge pull request #13969 from alalek:issue_13929

videoio: plugins, add strict checks

videoio: revert registry chages, update cap.cpp

videoio: update plugin API