Remove unused leftover GNUtoMS support file

Remove GNUtoMS code in favor of CMake builtin version - Thanks Brad (Kitware)

Require CMake >= 2.8.7 so we can use CMAKE_GNUtoMS

fix to bug report 4331

Split lines to make INtel Windows Compiler happy...

Correct bug reported by Alex Zotkevich from Intel
See: http://icl.utk.edu/lapack-forum/viewtopic.php?f=13&t=4392

Bug: During workspace computation, LAPACK code CGESVD was calling other
subroutines (e.g. CGEQRF) with REAL DUM variable as COMPLEX WORK variable.  DUM
(in CGESVD) is REAL while WORK (in called subroutines) is COMPLEX.  This
corrupts the stack when a value is set in WORK.

Fix: In CGESVD, use the COMPLEX CDUM variable (already present in the code)
instead of the REAL DUM variable.  Since I was at it, the COMPLEX "TAU"
variables (not referenced anyway) were passed the REAL DUM variable, I changed
the code so that the COMPLEX CDUM variable is passed. This is cleaner like
this.

Same problem with ZGESVD. Same fix.

Alex's post:
Hi, We recently found a stack corruption issue in (C,Z)GESVD that potentially
could even lead to incorrect xerbla error message.  In ZGESVD array DUM which
is used in LWORK query is a double precision array of size 1 allocated on
stack:
DOUBLE PRECISION DUM( 1 )
DUM comes to ( ZGEQRF, ZUNGQR, ... ) as a WORK array to return an optimal LWORK
value.  But in ( ZGEQRF, ZUNGQR, ... ) array WORK is declared as a COMPLEX*16
array. So WORK(1) = 1 corrupts the stack as it deals with complex value while
pointer on input of the function is a pointer to double: (oooooooo|xxxxxxxx),
oooooooo fills with LWORK value, xxxxxxxx corrupts. Let compiler use xxxxxxxx
to hold some value. After LWORK query the value will turn to be a zero.  "Hacky
fix" would be to allocate DUM array of size 2.
W.B.R.
Alex Zotkevich

Apply patch from Nadezhda Mozartova from Intel. (Sent to Julien on November
20th.) Thanks Nadezhda! Thanks Intel!

 Fix info value problem for (c,d,s,z)tgsy2.f reported by Elena Ivanova (ORACLE) - Sent Nov 20th

Applying 2nd part of Mathieu's patch - modification in the include file

Upadte version and date

Apply patch submitted by Matthew Faverge, INRIA on Nov 19th 2013

There are problems  in LAPACKE complex lacn2 interfaces. Those functions don't have a "isgn" parmeter in LAPACK. This exists only for real interface. The problem is present in the four files of C and Z functions.

In Lapack:
  SUBROUTINE ZLACN2( N, V, X, EST, KASE, ISAVE )

In Lapacke:
   LAPACK_zlacn2( &n, v, x, isgn, est, kase, isave );

LAPACK  bug fix for XBLAS: bug revealed in testing of linear equation routines, when XBLAS is linked

Update version and date on make.inc templates

fix Illegal grep pb in lapack_testing

Slight modification to Lawrence patch for xTPQRT - Update conditions for testing parameter L - MIN(M,N) can be 0

update ilaver

Update release number and date

Patch provided by Lawrence Mulholland from Nag on Nov 1st 2013

Email below:
============
I have been incorporating some routines into the NAG Library,
which means some automatic code translation and writing some
example and test programs.

The routines I have been adding are:
?geqrt, ?gemqrt, ?tpqrt, ?tpmqrt, ?orcsd, ?uncsd

At the end of this message I will give you my current svn status
and svn diff for consideration and approval before I commit.

In each case, when testing immediate exits, my tests failed because
constraints were mutually exclusive for the immediate return case.
I have already committed changes to the constraints for some of
the above to allow immediate exit.
I have completed this for the remainder of this set.

Less importantly, there are things in the code that trip up a checking
compiler:
  a) an
           IF ( clause1(i) .AND. clause2(array(i)) ) THEN

      where array(i) is either not initialized or is out of bounds if
      clause1(i) is .FALSE.

      This is wrong since a Fortran compiler is at liberty to test clause2 first.
      In my changes this has been split into two as best suits the case.

 b) an
          CALL SUB (i, array(N-i+2))
     with i = 1 and array(N+1) either not initialized or out of bounds, but
     internally array(N+1) is not referenced.

     In this case I don't think the Fortran standard is clear, but it trips up the
     nagfor compiler with checking on. So in the NAG incorporated versions
     of Lapack routines such calls are protected and/or
     a special i=1 call is made.
     The changes I want to commit also do this.

 c) workspace queries passing zero instead of array references
         e.g.
                lwork = -1
                call barf(n,m,0,0,0,0,0,-1,info)

     a checking compiler won't like this.
     I have changed cases like this to pass available arrays of sufficient size
     and the right shape in place of the zeros.

Typo in the comment on complex xHSEQR.
The formula:
(QZ)*H*(QZ)**H.
should read:
(QZ)*T*(QZ)**H.

Added check for NaN in input parameter G to avoid infinite loop -- fixes bug110.

FIX BUG 112.

    (Bug reported on Aug 18 2013 by Daniel Strobusch on LAPACK mailing list)
    (Bug fixed by Rodney on Aug 19 2013)

This is a problem with gfortran.  One need to force gfortran to allocate all
local arrays on the stack.  One way to do this is to have the option
-frecursive

 Remove unused code

Correct comment
Problem reported by Elena Ivanova <Elena.x.Ivanova@Oracle.com> on Sept 16th
"Both RES, and AYB have to be described as REAL."

Apply fix sent by Elena Ivanova (Oracle)

There is FPE in the 457th line of CDRVRFP:
cdrvrfp.f
(dbx) where
=>[1] cdrvrfp(nout = 6, nn = 9, nval = ARRAY, nns = 3, nsval = ARRAY, nnt = 9, ntval = ARRAY, thresh = 30.0, a = ARRAY, asav = ARRAY, afac = ARRAY, ainv = ARRAY, b = ARRAY, bsav = ARRAY, xact = ARRAY, x = ARRAY, arf = ARRAY, arfinv = ARRAY, c_work_clatms = ARRAY, c_work_cpot02 = ARRAY, c_work_cpot03 = ARRAY, s_work_clatms = ARRAY, s_work_clanhe = ARRAY, s_work_cpot01 = ARRAY, s_work_cpot02 = ARRAY, s_work_cpot03 = ARRAY), line 457 in "cdrvrfp.f"

MAIN(), line 244 in "cchkrfp.f"
When N=0, attempt to calculate a condition number → FPE, because we try to delete by zero (ANORM = 0.0, AINVNM = 0.0) in the 457th line:
Line 457:
      RCONDC = ( ONE / ANORM ) / AINVNM

Add small fixes sent by Ake Sandgren <ake.sandgren@hpc2n.umu.se>

Fix "if test" semantic in xdrvpox
Bug report sent by Elena Ivanova <elena.x.ivanova@oracle.com> on Sept 10th

typo in previous fix: MIN(M,N)>0 NOT MIN(M,N)<0 when checking NB>MIN(M,N)

Fix from Lawrence Mulholland (NAG).

From Lawrence:
The *GEQRT routines are supposed to return immediately when N=0 or M=0.
However the code is such that an INFO = -3 is triggered since we are
trying to satisfy
ELSE IF( NB.LT.1 .OR. NB.GT.MIN(M,N) )THEN
INFO = -3
should be
ELSE IF( NB.LT.1 .OR. ( NB.GT.MIN(M,N) .AND. MIN(M,N).LT.0 ) )THEN
INFO = -3

Also on a side note, I think we could allow NB to be greater than MIN(M,N) in
the interface and then reset NB as needed if the user's NB is too large.
Another day. Good enough for now.

Julien.

apply patch from Hong Xu

patch sent to lapack mailing list on Sunday July 21st

In the input parameter checking, LDZ was not checked correctly
LDZ was checked against M instead of N essentially

Add missing file in CMakeLists.txt

Added LAPACK tests for 'rook' routines and drivers to LIN/Makefile LIN/CMakeLists.txt

Modified test files for 'rook' pivoting LAPACK routines: LIN/cchkaa.f LIN/cchkhe_rook.f LIN/cdrvhe_rook.f LIN/cerrhe.f LIN/cerrvx.f LIN/zchkaa.f LIN/zchkhe_rook.f LIN/zdrvhe_rook.f LIN/zerrhe.f LIN/zerrvx.f ctest.in ztest.in

Added 'rook' LAPACK  routines and drivers to SRC/Makefile SRC/CMakeLists.txt

Modified new 'rook' pivoting routines and drivers for Hermitian indefinite matrices, Complex precision: zhetf2_rook.f zlahef_rook.f zhetri_rook.f

Modified new 'rook' pivoting routines and drivers for Hermitian indefinite matrices, Complex precision: chetf2_rook.f clahef_rook.f chetri_rook.f

modified error hadling routines for LIN testing of new Hermitian 'rook' pivoting code: aladhd.f

modified error hadling routines for LIN testing of new Hermitian 'rook' pivoting code: aladhd.f, alahd.f

bug fix provided by Elena Ivanova via email.

updated xlarfb routines

fixed array index problems in new CSD routines by adding MAX() to ensure index is at least 1 -- this fixes array bounds violations in the test suite when array bounds checking is enabled

Now using 2-norm to compute vector norms of row and column for balancing algorithm.
This seems to fix problems with balancing causing very large backward error for certain
Hessenberg matrices, including the often cited example of Watkins.

fixed comments in (c,z)errsy.f

changed comments in (c,z)hetf2.f

added LAPACK routine (c,z)hesv_rook.f

added LAPACK routine (c,z)hecon_rook.f

added LAPACK routine (c,z)hetri_rook.f

added LAPACK routine (c,z)hetrs_rook.f

added LAPACK routine (c,z)hetrf_rook.f

added LAPACK routines (c,z)hetf2_rook.f

fixed comments in LAPACK routines (c,z)lahef.f and (c,z)lahef_rook.f

fixed comments in LAPACK routines (c,z)lahef.f and (c,z)lahef_rook.f

Fixed comments in (c,z)lahef.f and (c,z)lahef_rook.f

added HR (Hermitian 'rook') path to LAPACK test routines alaerh.f alahd.f aladhd.f

changed comments in LAPACK testing routine (c,z)latb4.f

fixed comments in LAPACK testing routines (s,d,c,z)lavsy.f, (s,d,c,z)lavsy_rook.f (c,z)lavhe.f, (c,z)lavhe_rook.f

fixed comments in LAPACK test routines (s,d,c,z)syt01.f, (s,d,c,z)syt01_rook.f  and (c,z)het01.f, (c,z)het01_rook.f

minor changes in LAPACK testing routines (s,d,c,z)drvsy.f, (s,d,c,z)drvsy_rook.f, (c,z)drvhe.f, and (c,z)drvhe_rook.f

removed whitespace in LAPACK testing routines (s,d,c,z)chksy.f and (s,d,c,z)chksy_rook.f and (c,z)chkhe.f (c,z)chkhe_rook.fand minor modifications

changed comments in LAPACK testing routines (s,d,c,z)chksy.f and (s,d,c,z)chksy_rook.f (c,z)chkhe.f (c,z)chkhe_rook.fand minor modifications

changed comments in LAPACK testing routines (c,z)chksy.f and (c,z)chksy_rook.f (c,z)chkhe.f (c,z)chkhe_rook.f and minor modifications

changed comments in LAPACK testing routines (c,z)chksy.f and (c,z)chksy_rook.f (c,z)chkhe.f (c,z)chkhe_rook.f and minor modifications

changed comments in LAPACK testing routines (c,z)chksy.f and (c,z)chksy.f

changed coments in LAPACK testing routines (c,z)chksy.f and (c,z)chksy.f

added test routines (c,z)chkhe_rook.f  and (c,z)drvhe_rook.f  for Hermitian factorization routines with rook pivoting algorithm

added test routines (c,z)chkhe_rook.f  and (c,z)drvhe_rook.f  for Hermitian factorization routines with rook pivoting algorithm

 lapacke.h: template with C linkage error - forum topic 4221

removed references to example_ZGESV_rowmajor.c

removed example_ZGESV_rowmajor.c

corrected bug found by Tyrone Rees posted on email list:

"I think there's a bug in the routine dlaqp2.f in version 3.4.2 of LAPACK
(and possibly earlier). Line 220 of the source is
   IF( I.LE.N ) THEN
whereas for the other versions the same line reads
   IF( I.LT.N ) THEN

This difference appears to make the routine dgeqp3 fall over when asked
to do a factorization of the last two columns of a 10x5 matrix.  The NAG
fortran compiler gives the error:
 Subscript out of range for assumed-size array A - Access to element 22
but actual argument has only 20 elements
 Program terminated by fatal error

The single precision version runs without a hiccup.

Best wishes,

Tyrone"

Applied patch provided by Sergey Kuznetsov @ Intel, fixes bug where TAU2 can be uninitialized.

added code to set the last pivots to n: ipiv(n)=jpiv(n)=n

Update and add examples

Remove unused file

Fix typos in README

Add c/zlacp2 for PLASMA team

Updated comments in (s,d,c,z)lasy_rook.f and (c,z)lahe_rook.f

updated comments in (s,d,c,z)lasyf.f and  (c,z)lahef.f

Updated comments in (s,d,c,z)sytf2_rook.f

Updated comments in  (s,d,c,z)sytf2.f and (c,z)hetf2.f

updated comments in

fixed comments in clahef_rook.f and zlahef_rook.f

Commit Victor Liu's suggestion about making the complex division routine more robust
tests and builds seems fine.

Message sent on Oct 18th
I just saw a paper on ArXiv about making the complex division routine more robust:
http://arxiv.org/abs/1210.4539
Second author is actually the original inventor of the current algorithm in Lapack.
I have attached my modified DLADIV routine, which passes all the tests in the build process.

Replaced IF(J.LE.N) by IF(J.LT.N) for 'U', where U12 is put in standard form by partially undoing the interchanges, also added comments to the part where U21 is put in standard form; Similarly, replaced IF(J.GE.1) by IF(J.GT.1) for 'L', where L21 is put in standard form by partially undoing the interchanges, also added comments to the part where L21 is put in standard form; Affected files: zlahef.f clahef.f zlasyf.f clasyf.f dlasyf.f slasyf.f

fixed a typo in a comment in (c,z)lahef_rook.f

added clahef_rook.f and zlahef_rook.f

fixed a typo in a commnet in (c,z)lahef.f

(s,d,c,z)lasyf.f and (c,z)lahef.f: added comments to the part where a column or 2 columns are updated at each step

fixed comments in (s,d,c,z)lasyf.f and (c,z)lahef.f

updated comments for interchage of rows and columns in (s,d,c,z)lasyf.f and (c,z)lagef.f

Changed comment in (sdcz)lasyf.f and (cz)lahef.f about interchanges for 2x2 pivot

(s,d,c,z)lasyf.f: introduced from zlahef.f a more efficient version of the code that interchanges row and columns -- 1) for 'L' version: eliminated unnecessary copying to elemnents in cols. K (K and K+1 for 2x2 pivot) that later on will be overwritten by storing L(k) ( L(k) and L(k+1) for 2x2 pivot ) into these cols. 2) for 'U' version: eliminated unnecessary copying to elemnents in cols. K (K and K-1 for 2x2 pivot) that later on will be overwritten by storing L(k) ( L(k)and L(k-1) for 2x2 pivot ) into these cols.

updated comments in (c,z)lahef.f for column  interchange

(c,z)lahef.f: Changed the length of the swap vector from KK-1 to K-1 for the 'L' case and from N-KK to N-K for the 'U' case. It is sufficient to swap rows KK and KP only in the first K-1 columns of A instead of in the first KK-1 columns of A in 'L' case (columns K (or K and K+1) of A will be later overwritten). It is sufficient to swap rows KK and KP only in the last K+1 to N columns of A instead of in the last KK+1 to N columns of A in the 'U' case (columns K (or K and K-1) of A will be later overwritten).

fixesd inconsistencies between 'L' and 'U' parts in (z,c)lahef.f, added an IF check to 'U' part IF(KP.GT.1) where column interchange occurs

fixes to comments in *zlasyf_rook.f

fixes to comments in *lasyf_rook.f

fixes to comments in *lasyf_rook.f

removed extra characters after ZERO

Add xlacn2 for PLASMA team

fixes to documentation in clahef.f and zlahef.f