internal/ceres/single_linkage_clustering.cc

   1 // Ceres Solver - A fast non-linear least squares minimizer
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  27 // POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
  28 //
  29 // Author: sameeragarwal@google.com (Sameer Agarwal)
  30
  31 #include "ceres/single_linkage_clustering.h"
  32
  33 #include "ceres/graph.h"
  34 #include "ceres/collections_port.h"
  35 #include "ceres/graph_algorithms.h"
  36
  37 namespace ceres {
  38 namespace internal {
  39
  40 int ComputeSingleLinkageClustering(
  41     const SingleLinkageClusteringOptions& options,
  42     const WeightedGraph<int>& graph,
  43     HashMap<int, int>* membership) {
  44   CHECK_NOTNULL(membership)->clear();
  45
  46   // Initially each vertex is in its own cluster.
  47   const HashSet<int>& vertices = graph.vertices();
  48   for (HashSet<int>::const_iterator it = vertices.begin();
  49        it != vertices.end();
  50        ++it) {
  51     (*membership)[*it] = *it;
  52   }
  53
  54   for (HashSet<int>::const_iterator it1 = vertices.begin();
  55        it1 != vertices.end();
  56        ++it1) {
  57     const int vertex1 = *it1;
  58     const HashSet<int>& neighbors = graph.Neighbors(vertex1);
  59     for (HashSet<int>::const_iterator it2 = neighbors.begin();
  60          it2 != neighbors.end();
  61          ++it2) {
  62       const int vertex2 = *it2;
  63
  64       // Since the graph is undirected, only pay attention to one side
  65       // of the edge and ignore weak edges.
  66       if ((vertex1 > vertex2) ||
  67           (graph.EdgeWeight(vertex1, vertex2) < options.min_similarity)) {
  68         continue;
  69       }
  70
  71       // Use a union-find algorithm to keep track of the clusters.
  72       const int c1 = FindConnectedComponent(vertex1, membership);
  73       const int c2 = FindConnectedComponent(vertex2, membership);
  74
  75       if (c1 == c2) {
  76         continue;
  77       }
  78
  79       if (c1 < c2) {
  80         (*membership)[c2] = c1;
  81       } else {
  82         (*membership)[c1] = c2;
  83       }
  84     }
  85   }
  86
  87   // Make sure that every vertex is connected directly to the vertex
  88   // identifying the cluster.
  89   int num_clusters = 0;
  90   for (HashMap<int, int>::iterator it = membership->begin();
  91        it != membership->end();
  92        ++it) {
  93     it->second = FindConnectedComponent(it->first, membership);
  94     if (it->first == it->second) {
  95       ++num_clusters;
  96     }
  97   }
  98
  99   return num_clusters;
 100 }
 101
 102 }  // namespace internal
 103 }  // namespace ceres